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春華秋實(shí)2020金蟲 (正式寫手)
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[交流]
MS中建立石墨烯模型導(dǎo)入VASP中計(jì)算 已有6人參與
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最近為了在VASP中弛豫石墨烯，要在在MS中建立石墨烯模型，總結(jié)了一下步驟，僅供參考： 1、打開(kāi)material studio，新建一個(gè)工程，import石墨graphite.msi，在structure/ceramic中 2、build->make p1（目的是消除對(duì)稱性，這樣才能夠刪除一層原子）。 3、刪除一層原子（選中原子->delete），并移動(dòng)剩下的原子到中間。 4、構(gòu)建supercell（方便摻雜，也為了好看）：build->symetry->supercell，構(gòu)建一個(gè)6*6*1的超原胞，這樣建立的超胞模型是扶手型。 要建立鋸齒狀的，在建立supercell之前，build>symmetry>find symmetry,然后impose symmetry，此時(shí)只顯示兩個(gè)原子，然后建立supercell，6*6*1 （如果需要supercell是斜六面體，這樣就可以了，如果需要矩形，繼續(xù)下一步） 5、修改晶格參數(shù)：build->crystal->rebuild crystal，設(shè)置方位角和length。由斜六面體改為矩形首先改方位角，如果只改方位角，會(huì)發(fā)現(xiàn)周期性邊界變化， 所以還要修改length，修改以后變成矩形。我的是6*6*1,a：12.78，b:12.2999 6、下面就是需要導(dǎo)出到VASP中 點(diǎn)擊castep計(jì)算energy，保存file，到相應(yīng)文件夾下找到graphite (66-cub).cell文件，此文件為隱含文件，打開(kāi)，把相應(yīng)的lattice parameter和坐標(biāo)拷到POSCAR，就搞定了。 [ Last edited by 春華秋實(shí)2020 on 2013-5-15 at 17:28 ] |
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4樓2013-05-15 08:49:38
春華秋實(shí)2020
金蟲 (正式寫手)
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- 專業(yè): 光學(xué)
2樓2013-05-14 14:30:05
tsglss
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
3樓2013-05-15 07:51:01
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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5樓2013-05-15 08:51:59
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