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jackjiejl木蟲 (小有名氣)
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[求助]
VASP計(jì)算，坐標(biāo)原子固定方法|插件 已有2人參與
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通常在計(jì)算一個(gè)體系的時(shí)候，由于晶胞比較大，原子個(gè)數(shù)多，如果采用完全馳豫的話計(jì)算太耗時(shí)，并且不容易收斂，所以通常會(huì)選擇固定外圍骨架原子，只選擇反應(yīng)活性中心的部位原子可以馳豫，我一般都是把晶胞導(dǎo)出POSCAR后再根據(jù)MS里面結(jié)構(gòu)，一個(gè)一個(gè)查找需要馳豫的原子坐標(biāo)，手動(dòng)固定或者馳豫，小的還好，但是遇到多一點(diǎn)原子的情況，這樣做太費(fèi)時(shí)了還容易出錯(cuò)，大家通常怎么處理的？有沒(méi)有好的建議呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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jackjiejl
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比如說(shuō)我要在Si-O-Al結(jié)構(gòu)的骨架中吸附個(gè)丙酮小分子C H O ，但是骨架也有很多氧原子，我只是固定部分的原子，您說(shuō)的還是不行啊，沒(méi)有madeA。我在想有沒(méi)有小插件好用的呢 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2016-03-29 16:02:20
不取俗名
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4樓2016-03-29 17:47:44
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5樓2016-12-08 09:26:00
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