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jinling158銅蟲(chóng) (小有名氣)
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實(shí)時(shí)熒光PCR咨詢-不勝感激 已有2人參與
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我最近正研制細(xì)菌實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)試劑盒,但是碰到了一些問(wèn)題,兩三個(gè)月之前做出的靈敏度還可以,但三個(gè)月之后就靈敏度降低了,Ct值增加了2~3,但是試劑什么的都沒(méi)有變啊。我用的ABI預(yù)混液,難道是酶降解了(一直按照說(shuō)明書(shū)4度保存,但其中有一晚上冰箱壞了第2天上午修好了,這個(gè)應(yīng)該不會(huì)有影響吧)?另外,難道引物探針也降解了?引物探針的純化方式是PAGE,這種純化方式是不是沒(méi)有離子交換HPLC的純度和穩(wěn)定性好?都是PAGE純化,不同公司合成的探針質(zhì)量是不是不一樣呢?寶生物銷(xiāo)售跟我說(shuō)他們合成的探針質(zhì)量好。又或是我的DNA降解了?對(duì)于低濃度的質(zhì)粒DNA,有沒(méi)有好的保存方法啊?比如說(shuō)用低吸附的管子,里面要加一些什么樣的保護(hù)劑嗎?負(fù)20度還是負(fù)80度保存呢? 謝謝各位!對(duì)您的答復(fù)不勝感激! |
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我也一直在做Ct相關(guān)的qPCR,有幾種原因可能導(dǎo)致Ct靠后: 1.探針最好是HPLC純化方式,PAGE對(duì)探針來(lái)說(shuō)純化不夠,引物PAGE純化OK,不同廠商合成的有差異,TAKARA算不錯(cuò)的。 2.引物探針用TE溶解,并分裝,減少反復(fù)凍融,探針?lè)盅b于棕色不透明管防止熒光標(biāo)記降解。 3.模板降解:盡量用高濃度質(zhì)粒保存于-20度,少凍融,用于做靈敏度的質(zhì)粒濃度肯定很低,易降解,最好每次都用高濃度來(lái)現(xiàn)配現(xiàn)用。 希望對(duì)你有用。 |
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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靈敏度降低時(shí)很正常的,我們公司研發(fā)生產(chǎn)的試劑盒有些也會(huì)出現(xiàn)這種情況,產(chǎn)品正式輸出以前,都會(huì)做穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)的,反復(fù)凍融,實(shí)時(shí)穩(wěn)定性,開(kāi)瓶穩(wěn)定性等。我們說(shuō)明書(shū)上會(huì) 要求反復(fù)凍融不能超過(guò)三次,但是實(shí)際上有的凍融2次不光Ct值延后,而且熒光增峰也會(huì)下降。 我想問(wèn)一下你的ABI預(yù)混液是放到哪里保存的?酶是單獨(dú)添加的嗎? 我們調(diào)試試劑用的buffer和酶等原料都是自己配置的。 熒光PCR檢測(cè)試劑盒最重要的兩部分,一是探針引物的設(shè)計(jì)合成。二是酶反應(yīng)體系。你可以一項(xiàng)項(xiàng)的排除一下 |
銅蟲(chóng) (小有名氣)
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