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[求助] 用MPICH3.2, BLACS,LAPACK.SCALAPACK安裝siesta 已有1人參與

我用MPICH3.2, BLACS,LAPACK.SCALAPACK這幾個(gè)數(shù)學(xué)庫(kù)來(lái)安裝siesta，能夠順利的編譯過(guò)，但是在運(yùn)行的時(shí)候會(huì)報(bào)錯(cuò)。比如是在用范德瓦爾斯勢(shì)來(lái)計(jì)算單個(gè)原子的時(shí)候就會(huì)報(bào)錯(cuò)，MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 1.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.
這整個(gè)編譯過(guò)程中都沒(méi)有報(bào)錯(cuò)，我發(fā)現(xiàn)我改用openmpi的時(shí)候，也是一樣的報(bào)錯(cuò)。請(qǐng)問(wèn)高手如何解決呢。

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1樓 2016-08-11 10:22:37

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guohuazhong

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
漫天飄雪: 金幣+2, 謝謝交流 2016-08-12 15:28:14

在生成的arch.make文件中新加入
DUMMY_FOX= --enable-dummy
FFLAGS_DEBUG= -g -O2
而后在Obj文件夾中的makefile文件，將這幾行寫(xiě)成如下形式
(FoXconfigured)

cdFoX;toucharch.make; CONFIGURE="(FoXconfigured)

cdFoX;toucharch.make; CONFIGURE="(VPATH)/FoX/configure"; \
      $$CONFIGURE VPATH="$(VPATH)/FoX" \
      FC="$(FC_SERIAL)" FCFLAGS="$(FFLAGS_DEBUG)" \
      --enable-wcml $(DUMMY_FOX) || false )
注意(cd FoX; touch arch.make ; \這一行前是一個(gè)Tab空格，而不是一個(gè)space空格
將這兩個(gè)地方修改好后，
make clen
make

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5樓2016-08-12 15:17:26

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引用回帖:

5樓: Originally posted by guohuazhong at 2016-08-12 15:17:26
在生成的arch.make文件中新加入
DUMMY_FOX= --enable-dummy
FFLAGS_DEBUG= -g -O2
而后在Obj文件夾中的makefile文件，將這幾行寫(xiě)成如下形式
(FoXconfigured)

cdFoX;toucharch.make; CONFIGURE="(FoXconf ...

你的這個(gè)表情符號(hào)是什么格式呢？是/ng，還是/呢

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6樓2016-08-12 16:43:00

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這里的siesta是4.0.編譯在了虛擬機(jī)ubuntu上的，64位

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2樓2016-08-11 10:29:23

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自己再來(lái)頂一下，不要沉下去

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3樓2016-08-11 15:04:14

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quan3145

祝福祝福

4樓2016-08-11 15:51:38

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6樓: Originally posted by Alpha s at 2016-08-12 16:43:00
你的這個(gè)表情符號(hào)是什么格式呢？是/ng，還是/呢

...

這里還有兩個(gè)CONFIGURE是嗎？

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7樓2016-08-12 17:10:45

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cdFoX;toucharch.make; CONFIGURE="(FoXconf ...

我在arch.make 文件中加上了這兩句，并且修改了makefile文件中這幾句，結(jié)果還是不行呢，就是這個(gè)makefile文件在修改的這幾句不確定是不是對(duì)的，因?yàn)槲铱茨銓?xiě)的這個(gè)上面有兩個(gè)表情符號(hào)和兩個(gè)CONFIGURE,希望你有時(shí)間的時(shí)候幫我再看看，謝謝！

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8樓2016-08-12 17:47:32

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引用回帖:

8樓: Originally posted by Alpha s at 2016-08-12 17:47:32
我在arch.make 文件中加上了這兩句，并且修改了makefile文件中這幾句，結(jié)果還是不行呢，就是這個(gè)makefile文件在修改的這幾句不確定是不是對(duì)的，因?yàn)槲铱茨銓?xiě)的這個(gè)上面有兩個(gè)表情符號(hào)和兩個(gè)CONFIGURE,希望你有時(shí)間 ...

貼出你的arch.make文件吧

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9樓2016-08-12 18:31:41

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9樓: Originally posted by guohuazhong at 2016-08-12 18:31:41
貼出你的arch.make文件吧...

這個(gè)就是了

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附件 1 : arch.make

2016-08-13 10:12:24, 1.72 K

10樓2016-08-13 10:12:36

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