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大提質(zhì)粒時如何提高質(zhì)粒濃度? 已有7人參與
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用thermo的試劑盒從150ml菌液中提質(zhì)粒,最后用nano測只有200多ng/ml,別人一般都能提到900ng/ml左右,請問一下有什么需要注意的地方嗎,在操作過程中?謝謝 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
用戶注銷 (著名寫手)
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質(zhì)粒提取,不但困擾了好些新手,而且不少老手提取質(zhì)粒也不穩(wěn)定。 影響質(zhì)粒產(chǎn)量的因素很多,現(xiàn)列舉部分,望同道中人完善。 1、質(zhì)粒本身:高拷貝還是低拷貝,影響特別大。低拷貝的特定質(zhì)?梢钥紤]加氯霉素提高拷貝數(shù)(建議先了解氯霉素提高質(zhì)粒拷貝數(shù)的原理,應(yīng)該不是所有的都有效,可能起到相反效果)。 2. 宿主菌:常用的DH5α等,有利于得到高產(chǎn)量的質(zhì)粒。另外一些菌種效果可能差很多(同一實驗室用相同菌種,若別人得率高,應(yīng)該可以排除這個原因)。 3. 搖菌時間:這個影響非常大!有一些實驗者在這方面做得很不好。建議搖菌12-16小時,時間過短,單個菌體中的質(zhì)?截悢(shù)會低很多!時間過長,當(dāng)心細(xì)菌可能死亡,導(dǎo)致基因組污染等問題。特殊菌種、特殊搖菌溫度,時間需另行把握。 4. 搖菌用容器大。哼@個影響也是比較大的。搖150ml的菌液,應(yīng)該用500ml以上的搖菌瓶,效果比250ml或以下的要好;驹瓌t是搖菌容器的體積是菌液體積的4倍或以上。 5. 菌種來源:新轉(zhuǎn)化的菌種比凍存菌液要好。 6. 培養(yǎng)基:應(yīng)該用高品質(zhì)新配置的培養(yǎng)基。 7. 菌液用量:恰當(dāng)最好,寧少勿多。必須確保充分裂解,否則產(chǎn)量和純度會顯著降低。 8. 質(zhì)粒提取試劑盒的因素:現(xiàn)在市場上質(zhì)粒提取試劑盒很多,魚龍混雜。好些號稱高產(chǎn)、高純度無內(nèi)毒素大提,實際產(chǎn)量和純度堪憂。OD260判斷濃度、OD260/OD280和OD260/OD230比值判斷純度,很多時候并不客觀。好些情況下,雜質(zhì)含量高,OD260、280、230差不多按比例升高,比值好并不代表純度就一定好、建議進(jìn)一步瓊脂糖膠電泳。(同一實驗同一試劑盒,可排除這方面因素)。 9. 其它因素:待大家補(bǔ)充。 |
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