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[求助]
怎樣用一段基因和基因組的序列進行比對呢？
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求助：我想要做一個苜蓿的基因定量，可是沒有序列不能設計引物，所以想拿擬南芥的這個基因和苜蓿的基因組進行比對，得到序列后設計引物，可是不知道這么做對不對，還有不知道怎么比對？如果想法不對請知道的大神指點！急急急！有誰知道請幫忙，萬分感謝！ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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ygidtu
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就是那擬南芥的那個基因，去匹配苜蓿的基因組，blast出來的相似性高的應該就是么，如果所有數(shù)據(jù)都在你本地，你可以本地跑一個看看。畢竟如果你在線的不好，本地跑一下我感覺更能確定原因。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
13樓2016-10-16 20:39:57
ygidtu
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菱紫3693樓2016-10-16 19:39:29
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西門吹雪170: 金幣+1, 鼓勵回帖交流 2016-10-16 22:22:38
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可以先去NCBI將苜蓿的序列全部下載下來，然后blast，這樣才可靠，你要是擬南芥的話，必須找一些保守區(qū)域，也有可能出現(xiàn)問題，而且費些時間 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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4樓2016-10-16 19:42:20
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