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[求助]
怎樣用一段基因和基因組的序列進行比對呢？
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求助：我想要做一個苜蓿的基因定量，可是沒有序列不能設計引物，所以想拿擬南芥的這個基因和苜蓿的基因組進行比對，得到序列后設計引物，可是不知道這么做對不對，還有不知道怎么比對？如果想法不對請知道的大神指點！急急急！有誰知道請幫忙，萬分感謝！ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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ygidtu
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3樓2016-10-16 19:39:29
ygidtu
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2樓2016-10-16 19:38:15
李保磊
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西門吹雪170: 金幣+1, 鼓勵回帖交流 2016-10-16 22:22:38
西門吹雪170: 金幣+1, 鼓勵回帖交流 2016-10-16 22:22:38
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可以先去NCBI將苜蓿的序列全部下載下來，然后blast，這樣才可靠，你要是擬南芥的話，必須找一些保守區(qū)域，也有可能出現(xiàn)問題，而且費些時間 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
4樓2016-10-16 19:42:20
送紅花一朵 |
不下載下來比，用NCBI在線的雙序列比對可以嗎？怎么區(qū)分是保守區(qū)域還是不保守區(qū)域呢？我用在線的雙序列比對拿擬南芥的幾丁質酶基因和蒺藜苜蓿的全基因組比對，沒比對出來！我這m做是不是不對啊…… 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
5樓2016-10-16 20:01:08
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