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Forcite 幾何優(yōu)化有機小分子 已有1人參與
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小白剛開始學習MS,目標是用MS算有機小分子的溶解度參數(shù) 在結(jié)構(gòu)優(yōu)化一步就被卡了好久,用amorphous cell構(gòu)建了包含50個小分子的盒子,其中number of configurations用了默認的10 然后用Forcite做幾何優(yōu)化,能量圖的X軸竟然是frame,只從1走到10,我想大概是算每個構(gòu)型的能量吧,可是x軸不應(yīng)該是優(yōu)化步數(shù)嗎? 為何優(yōu)化一個小分子的時候X軸就是優(yōu)化步數(shù)呀?優(yōu)化盒子和小分子參數(shù)設(shè)置變化很大嗎? 研究了MS8.0→Forcite→Calculation→Geometry Optimization里面所有需要設(shè)置的地方以及help里面都看不到涉及這個問題的解釋,求大神給看看 |



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