 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1619 | 回復(fù): 7 | ||
許你安然然新蟲(chóng) (初入文壇)
|
[求助]
復(fù)合物中的配體是短肽，怎么刪除配體，僅保留受體蛋白呢？ 已有1人參與
|
|
如題，新手，剛剛接觸分子模擬，看過(guò)其他帖子配體都是小分子，如果配體也是蛋白應(yīng)該怎么刪除呢？ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
本科新能源科學(xué)與工程，一志愿華理能動(dòng)285求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿華北電力大學(xué)能動(dòng)專(zhuān)碩，293，求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
調(diào)劑310
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
食品工程專(zhuān)碩一志愿中海洋309求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
275求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
283求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085602 化工專(zhuān)碩 338分 求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
312，生物學(xué)求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
化學(xué)0703 調(diào)劑 306分 一志愿211
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
311（085601）求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 海洋王國(guó)種子 雷聲種子 新版標(biāo)準(zhǔn)日語(yǔ)種子 英語(yǔ)種子
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 值得精讀的一篇國(guó)內(nèi)發(fā)表的Nature Chemical Biology
已經(jīng)有29人回復(fù)
- 【交流】2011年度國(guó)家重大科學(xué)研究計(jì)劃重要支持方向
已經(jīng)有0人回復(fù)
- 【交流】【圖書(shū)】生物分析中的核酸適配體
已經(jīng)有2人回復(fù)
- 【分享】蛋白質(zhì)純化個(gè)人總結(jié)2
已經(jīng)有38人回復(fù)
2樓2017-03-23 20:52:14
hclwonder
新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 2564.1
- 紅花: 28
- 帖子: 371
- 在線: 68.2小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2837657
- 注冊(cè): 2013-11-30
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息
|
一般會(huì)是兩條鏈chain，選中多肽那條刪去再保存即可。找個(gè)合適的分子顯示軟件比如ds的client或者schrodinger的maestro或者其它軟件。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
3樓2017-03-23 21:54:59
許你安然然
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 71.5
- 帖子: 13
- 在線: 7.1小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 3762940
- 注冊(cè): 2015-03-25
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 生物物理、生物化學(xué)與分子
|
請(qǐng)問(wèn)我用pymol選中了后面的一段蛋白，然后刪掉了，這樣可以嗎？原pdb是x-ray得到的，是不是沒(méi)有水��？ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
4樓2017-03-24 19:15:21
hclwonder
新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 2564.1
- 紅花: 28
- 帖子: 371
- 在線: 68.2小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2837657
- 注冊(cè): 2013-11-30
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息
|
pymol我不大熟，按說(shuō)應(yīng)該可以。x衍射得到的晶體結(jié)構(gòu)不一定沒(méi)有水，要具體看。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
5樓2017-03-24 19:19:28
|
在DS里，蛋白晶體數(shù)據(jù)中的蛋白鏈，水，DNA，配體等都給你分門(mén)別類(lèi)了，你只需要選中相應(yīng)的配體，刪除就可以了。你不能直接在蛋白圖上選中地段刪除。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
6樓2017-03-24 19:45:45
hclwonder
新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 2564.1
- 紅花: 28
- 帖子: 371
- 在線: 68.2小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2837657
- 注冊(cè): 2013-11-30
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
|
pymol在display菜單可以選擇顯示sequence，在sequence選中不想要的peptide，右鍵remove刪除；如果要去掉水（假如有的話），右側(cè)點(diǎn)“A”-“remove waters”即可。 然后file-save molecule，完成。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
7樓2017-03-24 22:42:43
許你安然然
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 71.5
- 帖子: 13
- 在線: 7.1小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 3762940
- 注冊(cè): 2015-03-25
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 生物物理、生物化學(xué)與分子
8樓2017-03-25 11:26:20
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 許你安然然 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 085602 化工專(zhuān)碩 338分 求調(diào)劑 +12 | 路癡小琪 2026-03-27 | 12/600 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +6 | 星野? 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑求院校招收 +4 | 鶴鯨鴿 2026-03-28 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +6 | 材料cailiao 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +7 | A child 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0856，材料與化工321分求調(diào)劑 +12 | 大饞小子 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 277跪求調(diào)劑 +5 | 1915668 2026-03-27 | 9/450 |
|
|
|
[有機(jī)交流]
高溫高壓反應(yīng)求助
 10+4
|
chibby 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿南師大0703化學(xué) 275求調(diào)劑 +4 | Ripcord上岸 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料292調(diào)劑 +12 | 橘頌思美人 2026-03-23 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 08開(kāi)頭275求調(diào)劑 +4 | 拉誰(shuí)不重要 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +5 | 哇盧卡庫(kù) 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 22408 359分調(diào)劑 +3 | Qshers 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)338求調(diào)劑！ +6 | Zuhui0306 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑求收留 +7 | 果然有我 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿天津大學(xué)339材料與化工求調(diào)劑 +3 | 江往賣(mài)魚(yú) 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +5 | 話梅糖111 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿武理085500機(jī)械專(zhuān)業(yè)總分300求調(diào)劑 +3 | an10101 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 336化工調(diào)劑 +4 | 王大坦1 2026-03-23 | 5/250 |
|