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minmin_0082003金蟲 (正式寫手)
莫愁莫愁
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[交流]
【求助】siesta如何讓固定襯底? 已有7人參與
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在計(jì)算多層的surface的時(shí)候,常常會(huì)固定除表層外的其他層面,請(qǐng)問(wèn)在固定的過(guò)程中是,直接固定每層的每個(gè)原子就可以嗎? 比如說(shuō),我一共要算4層的,但是要固定底下面的3層。我把每個(gè)原子都固定住了,如下: %block GeometryConstraints Position 1 position from 3 to 5 position from 5 to 9 position from 11 to 13 position from 15 to 17 position from 19 to 21 position from 23 to 25 position from 27 to 29 position from 31 to 33 position from 35 to 36 %endblock GeometryConstraints 這樣的固定方法正確。 |
siesta問(wèn)題 |
銅蟲 (初入文壇)
木蟲 (著名寫手)
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你的這種方法可行@ 還有一種方法,就是使用zmtrix,如下: %block Zmatrix cartesian 4 0.832500 1.441900 0.070000 0 0 0 4 0.832500 4.325700 0.070000 0 0 0 4 0.832500 7.209500 0.070000 0 0 0 4 3.329900 0.000000 0.070000 0 0 0 4 3.329900 2.883800 0.070000 0 0 0 4 3.329900 5.767600 0.070000 0 0 0 4 5.827400 -1.441900 0.070000 0 0 0 4 5.827400 1.441900 0.070000 0 0 0 4 5.827400 4.325700 0.070000 0 0 0 1 3.602290 1.731278 6.212320 1 1 1 1 3.319832 2.314888 7.483680 1 1 1 1 2.095981 1.995008 8.160953 1 1 1 1 1.179880 1.055287 7.579063 1 1 1 1 1.463109 0.470284 6.307043 1 1 1 1 2.686364 0.792157 5.629784 1 1 1 2 4.560824 2.006388 5.644557 1 1 1 2 4.060912 3.044923 7.962504 1 1 1 2 0.218799 0.778868 8.141618 1 1 1 2 0.720051 -0.260182 5.831012 1 1 1 2 2.264637 3.524194 9.544223 1 1 1 2 0.774280 2.665518 9.602215 1 1 1 2 4.021096 0.084236 4.221899 1 1 1 2 2.491712 -0.710195 4.216641 1 1 1 3 1.840356 2.531978 9.498710 0 0 1 3 2.958183 0.262423 4.292613 0 0 1 4 2.438337 1.576108 2.385995 0 0 1 4 2.578104 1.329674 11.405459 0 0 1 4 1.665000 0.000000 13.722500 0 0 0 4 1.665000 2.883800 13.722500 0 0 0 4 1.665000 5.767600 13.722500 0 0 0 4 4.162400 -1.441900 13.722500 0 0 0 4 4.162400 1.441900 13.722500 0 0 0 4 4.162400 4.325700 13.722500 0 0 0 4 6.659800 -2.883800 13.722500 0 0 0 4 6.659800 0.000000 13.722500 0 0 0 4 6.659800 2.883800 13.722500 0 0 0 %endblock Zmatrix 第一列是元素序號(hào),后面三列是相應(yīng)的原子的cartesian坐標(biāo),后面的0表示固定相應(yīng)的自由度,1表示放開相應(yīng)的自由度!這個(gè)你可以從手冊(cè)找到!我用過(guò)這種固定方法,并且,還可以加限制! |

木蟲 (著名寫手)

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