 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 534 | 回復(fù): 3 | |||
yyx19840628木蟲 (著名寫手)
鷹的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
|
[交流]
【求助】DS軌跡可以放到VMD嗎 已有1人參與
|
|
1、溶劑化得時候是使用默認的7 但邊長是多少呢？ 一般看文章好像說明了。 自己也不知道。 2、還有請問VMD可以分析DS跑完的軌跡嗎？msv的那個文件。 我要看兩個質(zhì)心之間的距離，DS好像只能顯示一個質(zhì)心。不知道怎么弄。 3、The starting structures of the MD simulations were prepared with molecular mechanics (MM) optimizations, using the consistent-valence force-field (CVFF) 這段里面MM方法優(yōu)化請問怎么在DS里做。還是在高斯里做。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
求調(diào)劑一志愿武漢理工大學(xué)材料工程（085601）
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
一志愿C9材料與化工專業(yè)總分300求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
321求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
307求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
293求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
085602 289分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿北京化工大學(xué)材料與化工 264分各科過A區(qū)國家線
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
277分求調(diào)劑，跨調(diào)材料
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料292調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料與化工考研調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 如何把lammps的軌跡文件轉(zhuǎn)化為視頻呢？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- LAMMPS的軌跡文件怎么轉(zhuǎn)換為VMD的PDB文件
已經(jīng)有7人回復(fù)
- vmd如何遠程加載分子動力學(xué)軌跡？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【分享】分子模擬中作圖和看軌跡的軟件vmd windows版下載及使用手冊
已經(jīng)有13人回復(fù)
2樓2010-03-23 10:47:52
cy2003
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 140.1
- 帖子: 24
- 在線: 1.1小時
- 蟲號: 999499
- 注冊: 2010-04-17
- 專業(yè): 生物化學(xué)
★ ★
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-05-30 10:05:00
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-05-30 10:05:00
|
3、The starting structures of the MD simulations were prepared with molecular mechanics (MM) optimizations, using the consistent-valence force-field (CVFF) 這段里面MM方法優(yōu)化請問怎么在DS里做。還是在高斯里做。 ------------------------------------------------ 高斯里面的MM好像還沒DS好吧…… 我用DS的時候，是有個“minimization”模塊的，就是用于優(yōu)化。這個minimization優(yōu)化之前需要加力場，還有優(yōu)化函數(shù)的選擇。因為我做的是多肽，一般先用最陡下降法，然后用共軛梯度法。這個優(yōu)化函數(shù)的選擇，一般都有適當建議的。 |
3樓2010-05-30 09:54:37
yyx19840628
木蟲 (著名寫手)
鷹的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 貴賓: 0.41
- 金幣: 3521.9
- 散金: 50
- 紅花: 8
- 帖子: 2321
- 在線: 129小時
- 蟲號: 508615
- 注冊: 2008-02-21
- 性別: MM
- 專業(yè): 環(huán)境污染化學(xué)
4樓2016-01-17 20:34:01
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 yyx19840628 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研]
 材料與化工考研調(diào)劑
+6
|
孅華 2026-03-22 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑，求導(dǎo)師收 +3 | 天天好運來上岸?/a> 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
[考研] 298-一志愿中國農(nóng)業(yè)大學(xué)-求調(diào)劑 +11 | 手機用戶 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 335求調(diào)劑 +4 | yuyu宇 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +8 | hhhhxn.. 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +4 | LHHL66 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 352求調(diào)劑 +3 | 大米飯！ 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +8 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +7 | 懷瑾握瑜l 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 286分人工智能專業(yè)請求調(diào)劑愿意跨考！ +4 | lemonzzn 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿南大，0703化學(xué)，分數(shù)336，求調(diào)劑 +3 | 收到VS 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿深大，0703化學(xué)，總分302，求調(diào)劑 +4 | 七月-七七 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +12 | 梁梁校校 2026-03-19 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 一志愿武理材料305分求調(diào)劑 +6 | 想上岸的鯉魚 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑材料與化工專碩 +15 | 陌の森林 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研]
材料與化工 322求調(diào)劑
+4
|
然11 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 中南大學(xué)化學(xué)學(xué)碩337求調(diào)劑 +3 | niko- 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交通 專碩 材料355 本科雙非 求調(diào)劑 +5 | 西南交通專材355 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿南理工085701環(huán)境302求調(diào)劑院校 +3 | 葵梓衛(wèi)隊 2026-03-20 | 3/150 |
|