 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜 |
- >論壇更新日志 (5710)
- >考研 (1258)
- >導(dǎo)師招生 (1086)
- >文獻(xiàn)求助 (420)
- >蟲(chóng)友互識(shí) (265)
- >考博 (174)
- >碩博家園 (119)
- >博后之家 (101)
- >基金申請(qǐng) (98)
- >招聘信息布告欄 (81)
- >論文投稿 (81)
- >第一性原理 (65)
- >休閑灌水 (63)
- >教師之家 (60)
- >公派出國(guó) (36)
- >外文書(shū)籍求助 (29)
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 535 | 回復(fù): 3 | |||
yyx19840628木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
鷹的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
|
[交流]
【求助】DS軌跡可以放到VMD嗎 已有1人參與
|
|
1、溶劑化得時(shí)候是使用默認(rèn)的7 但邊長(zhǎng)是多少呢？ 一般看文章好像說(shuō)明了。 自己也不知道。 2、還有請(qǐng)問(wèn)VMD可以分析DS跑完的軌跡嗎？msv的那個(gè)文件。 我要看兩個(gè)質(zhì)心之間的距離，DS好像只能顯示一個(gè)質(zhì)心。不知道怎么弄。 3、The starting structures of the MD simulations were prepared with molecular mechanics (MM) optimizations, using the consistent-valence force-field (CVFF) 這段里面MM方法優(yōu)化請(qǐng)問(wèn)怎么在DS里做。還是在高斯里做。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
資源與環(huán)境 調(diào)劑申請(qǐng)(333分)
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
306求0703調(diào)劑一志愿華中師范
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
【考研調(diào)劑】化學(xué)專(zhuān)業(yè) 281分，一志愿四川大學(xué)，誠(chéng)心求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑，求導(dǎo)師收
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
070300化學(xué)求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
300分，材料，求調(diào)劑，英一數(shù)二
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料學(xué)碩，求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
289求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 如何把lammps的軌跡文件轉(zhuǎn)化為視頻呢？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- LAMMPS的軌跡文件怎么轉(zhuǎn)換為VMD的PDB文件
已經(jīng)有7人回復(fù)
- vmd如何遠(yuǎn)程加載分子動(dòng)力學(xué)軌跡？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【分享】分子模擬中作圖和看軌跡的軟件vmd windows版下載及使用手冊(cè)
已經(jīng)有13人回復(fù)
2樓2010-03-23 10:47:52
cy2003
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 140.1
- 帖子: 24
- 在線: 1.1小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 999499
- 注冊(cè): 2010-04-17
- 專(zhuān)業(yè): 生物化學(xué)
★ ★
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-05-30 10:05:00
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-05-30 10:05:00
|
3、The starting structures of the MD simulations were prepared with molecular mechanics (MM) optimizations, using the consistent-valence force-field (CVFF) 這段里面MM方法優(yōu)化請(qǐng)問(wèn)怎么在DS里做。還是在高斯里做。 ------------------------------------------------ 高斯里面的MM好像還沒(méi)DS好吧…… 我用DS的時(shí)候，是有個(gè)“minimization”模塊的，就是用于優(yōu)化。這個(gè)minimization優(yōu)化之前需要加力場(chǎng)，還有優(yōu)化函數(shù)的選擇。因?yàn)槲易龅氖嵌嚯�，一般先用最陡下降法，然后用共軛梯度法。這個(gè)優(yōu)化函數(shù)的選擇，一般都有適當(dāng)建議的。 |
3樓2010-05-30 09:54:37
yyx19840628
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
鷹的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 貴賓: 0.41
- 金幣: 3521.9
- 散金: 50
- 紅花: 8
- 帖子: 2321
- 在線: 129小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 508615
- 注冊(cè): 2008-02-21
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 環(huán)境污染化學(xué)
|
給五年前的自己回復(fù)，說(shuō)實(shí)話，我現(xiàn)在看不懂那時(shí)候想要問(wèn)什么，好深?yuàn)W的說(shuō)。 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶(hù)端 |
4樓2016-01-17 20:34:01
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 yyx19840628 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿南航材料專(zhuān)317分求調(diào)劑 +5 | 炸呀炸呀炸薯?xiàng)l 2026-03-23 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿211 初試270分 求調(diào)劑 +5 | 谷雨上岸 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料專(zhuān)碩331求調(diào)劑 +4 | 鮮當(dāng)牛 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +7 | 某某某某位 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +5 | 匹克i 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 07化學(xué)280分求調(diào)劑 +4 | 722865 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 335求調(diào)劑 +4 | yuyu宇 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿國(guó)科過(guò)程所081700，274求調(diào)劑 +3 | 三水研0水立方 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工085600，總分304，本科有兩篇sci參與，求調(diào)劑 +4 | 幸運(yùn)的醬醬 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑院校信息 +6 | CX 330 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料求調(diào)劑 +5 | @taotao 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +3 | 喜歡還是不甘心 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，求調(diào)劑 +5 | 材化逐夢(mèng)人 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 22408 344分 求調(diào)劑 一志愿 華電計(jì)算機(jī)技術(shù) +4 | solanXXX 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專(zhuān)碩調(diào)劑 +9 | Doleres 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿:南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分 +4 | @taotao 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿南京航空航天大學(xué)289分 +3 | @taotao 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005 +5 | ioodiiij 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|