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[交流]
【求助】蛋白質(zhì)的RMSD均方根差指的是什么 已有6人參與
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amber | gromacs |
金蟲 (文壇精英)
老漢一枚
金蟲 (文壇精英)
老漢一枚
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簡單地說,就是蛋白質(zhì)上的原子們,在各個時(shí)間上的位置的變化情況。 原子i在t1時(shí)的位置 - 原子i在t2時(shí)的位置,得到原子i的位置變化 計(jì)算其平方 ..... 把多個原子(i=1...N)的這個平方,都加起來 除以原子數(shù),得到所謂“均方” 開方 搞成平方,是為了避免出現(xiàn)負(fù)值 再開方,是為了得到長度的量綱 一種簡單的小技巧而已 你也可以自己發(fā)明類似的算法 [ Last edited by yalefield on 2010-5-12 at 12:05 ] |
金蟲 (著名寫手)

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