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zhangdagou5858銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
【討論】同一蛋白質(zhì)分成不同部分建模得到的結(jié)構(gòu)如何生成一個(gè)結(jié)構(gòu)? 已有8人參與
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我對(duì)一個(gè)跨膜蛋白質(zhì)psi-blast后（1-442AA），發(fā)現(xiàn)序列同源性不高，僅66-413AA有序列相似性很高的pdb結(jié)構(gòu)用來建模，也就是說前面有接近65AA無法用同源建模方法來建模，我的思路是前面65AA采用線索(threading)法產(chǎn)生模型，66-413AA采用同源建模方法產(chǎn)生模型。現(xiàn)在的問題是怎么將得到的兩個(gè)子模型合成一個(gè)完整的模型呢（1-442AA）？對(duì)這種蛋白質(zhì)建模，大家有什么好的辦法么？提示個(gè)思路 這種情形很常見，請(qǐng)大家暢所欲言 |
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ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-05-31 16:03:55
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-05-31 16:03:55
| threading的軟件很多，對(duì)于蛋白質(zhì)的建模的軟件，推薦一個(gè)網(wǎng)站，幾乎收錄了所有建模軟件和在線服務(wù)器，http://expasy.org/tools/ |
3樓2010-05-31 09:53:12
chongchong11
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