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[交流]
【討論】同一蛋白質分成不同部分建模得到的結構如何生成一個結構? 已有8人參與
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我對一個跨膜蛋白質psi-blast后(1-442AA),發(fā)現(xiàn)序列同源性不高,僅66-413AA有序列相似性很高的pdb結構用來建模,也就是說前面有接近65AA無法用同源建模方法來建模,我的思路是前面65AA采用線索(threading)法產生模型,66-413AA采用同源建模方法產生模型。現(xiàn)在的問題是怎么將得到的兩個子模型合成一個完整的模型呢(1-442AA)?對這種蛋白質建模,大家有什么好的辦法么?提示個思路 這種情形很常見,請大家暢所欲言 |
精華帖轉載 |
金蟲 (正式寫手)
木蟲 (正式寫手)
| threading的軟件很多,對于蛋白質的建模的軟件,推薦一個網(wǎng)站,幾乎收錄了所有建模軟件和在線服務器,http://expasy.org/tools/ |
至尊木蟲 (著名寫手)
Senior Engineer

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