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yangyingwe新蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助】請教關(guān)于電子密度分布圖的問題 已有3人參與
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| 請教哪位高手，如何將MS中的電子密度分布圖保存為論文中可以用的平面電子密度分布圖，而且要美觀的那種，大家?guī)蛶兔ρ剑x謝哦 |
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zzgyb
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MS中如何做二維電子密度圖
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
gavinliu7390(金幣+3):謝謝交流！ 2010-06-07 22:39:43
xiaohunhun(金幣+3):謝謝 2010-06-08 15:54:37
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xiaohunhun(金幣+3):謝謝 2010-06-08 15:54:37
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1、首先計算出電子密度，這個不用講了； 2、然后，選中3D原子文件，分析，選電子密度，同時選上等值面； 3、先save－－>.grd文件。 它的文件格式為： a b c Charge 1 1 1 20.4291333179468 2 1 1 21.703304660858524 3 1 1 25.528902136817084 4 1 1 31.530000049221105 5 1 1 39.074431775541491 6 1 1 46.869700929673286 .................................................... 4、這時候你如果import的話，就會看見電子密度圖了。 5、下面就到問題的關(guān)鍵了，用MATLAB轉(zhuǎn)換繪圖。 1）從上面的文件內(nèi)容我們可以知道，其內(nèi)容格式十分整齊，就是a b c 坐標(biāo)然后跟著該點(diǎn)上的電荷密度，而且坐標(biāo)都是整數(shù)。 比如計算的材料是正交系的，三個角都是直角，而且a b c的值都是1到45，你就可以可以偷懶。 2）數(shù)據(jù)的輸入及轉(zhuǎn)換 在MATLAB中，用csvread先讀入電子密度，設(shè)為V; 再重整：V=RESHAPE(v,45,45,45)； 3）坐標(biāo)點(diǎn)的整理 先在MS中確定用a面，就是b,c面，和a軸垂直的，那個面（100），得到一組 normal和 position屬性，position假定為3.17 然后mesh格點(diǎn)： [sy,sz]=meshgrid(1:45,1:45) sx=zeros(45,45)+3.17 這樣數(shù)據(jù)就整理好了。 4）繪圖 繪圖： contourslice(V,sx,sy,sz) [ Last edited by zzgyb on 2010-6-8 at 12:28 ] |
2樓2010-06-07 11:31:01
yangyingwe
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5樓2011-09-23 16:58:58
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