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[交流]
【求助】請教關于電子密度分布圖的問題 已有3人參與
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| 請教哪位高手,如何將MS中的電子密度分布圖保存為論文中可以用的平面電子密度分布圖,而且要美觀的那種,大家?guī)蛶兔ρ剑x謝哦 |
科研相關資料 | 第一性原理 | 差分電荷密度 |
銅蟲 (著名寫手)
榮譽版主 (文壇精英)
小木蟲警察局局長
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1、首先計算出電子密度,這個不用講了; 2、然后,選中3D原子文件,分析,選電子密度,同時選上等值面; 3、先save-->.grd文件。 它的文件格式為: a b c Charge 1 1 1 20.4291333179468 2 1 1 21.703304660858524 3 1 1 25.528902136817084 4 1 1 31.530000049221105 5 1 1 39.074431775541491 6 1 1 46.869700929673286 .................................................... 4、這時候你如果import的話,就會看見電子密度圖了。 5、下面就到問題的關鍵了,用MATLAB轉換繪圖。 1)從上面的文件內容我們可以知道,其內容格式十分整齊,就是a b c 坐標然后跟著該點上的電荷密度,而且坐標都是整數。 比如計算的材料是正交系的,三個角都是直角,而且a b c的值都是1到45,你就可以可以偷懶。 2)數據的輸入及轉換 在MATLAB中,用csvread先讀入電子密度,設為V; 再重整:V=RESHAPE(v,45,45,45); 3)坐標點的整理 先在MS中確定用a面,就是b,c面,和a軸垂直的,那個面(100),得到一組 normal和 position屬性,position假定為3.17 然后mesh格點: [sy,sz]=meshgrid(1:45,1:45) sx=zeros(45,45)+3.17 這樣數據就整理好了。 4)繪圖 繪圖: contourslice(V,sx,sy,sz) [ Last edited by zzgyb on 2010-6-8 at 12:28 ] |

銅蟲 (著名寫手)
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