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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 量子化學 » Gaussian » 【求助】g09如何指定內存
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ter20鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助】g09如何指定內存 已有4人參與
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用了g09之后，還是像過去用g03那樣，用"%mem=800MW"指定內存，可是交了任務開始算后，總是顯示如下： 內存總是顯示只用了零點幾或是一點幾，不知道是指定內存的關鍵字用錯了（個人覺得不是，因為g09沒有報錯），還是g09的問題？（機器應該沒有問題，因為用g03和別的軟件都不存在這個問題） 希望高手解答，多謝了！ |
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aylayl08(金幣+1):感謝討論 2010-07-07 15:18:42
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http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2085070 我早就發(fā)現(xiàn)這個問題了，無解 |
2樓2010-07-06 21:23:42
sunlong650
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3樓2010-07-06 21:35:22
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aylayl08(金幣+8):感謝詳細介紹 2010-07-07 15:19:21
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知道800mw相當于多少mb嗎？是6400mb= 6.4GB gaussian說明書中提到計算效率的時候有說明各個計算任務所需內存大小的估算 普通計算過程如L401，L502等計算所需內存一般僅有幾十兆或幾百兆就可以了 當然體系大些所需內存也會相應增加 與basis set成二次方 如果指定的內存很大，計算任務用不了那么大，就會有很多空閑內存。系統(tǒng)需要去處理一下去選擇多少內存合適。這樣也會降低一些計算效率的。 當計算freq也就是在L1102進程中，對內存的需求比較大，有一個命令freqmem 可以幫你計算一個體系所需內存的大小，與開殼層閉殼層、basis set數(shù)目、原子數(shù)目、基組劈裂方式等有關。 另外串行和并行之間內存的需求也是不同的，如1nproc所需內存為1GB，2nproc則為1.75GB,有一個公式可以幫助大家估算并行的內存：Mem(n proc) = Mem (1 proc) *（0.75* n + 0.25） 因此，提交任務之前最好估算一下計算所需內存的估算值。這樣才能保證較高的計算效率。 如果計算任務設定的內存小于所需內存，則在計算的時候就會被迫降低效率或是使用更大的硬盤來彌補內存的不足，內存最好不要小于計算所需最小值； 例如當內存不夠用的時候，計算freq時常常出現(xiàn) CoulSu: requested number of processors reduced to: 1 ShMem 1 Linda 這是gaussian進行了降低并行效率的處理。這個時候你會發(fā)現(xiàn)cpu的并行數(shù)目要小于你的設定值。 當物理內存或是硬盤不能滿足所需內存的最小值時，就會報錯停止計算，好像是出現(xiàn)Netrr Error。 希望會對大家有幫助。 [ Last edited by xiaoma541 on 2010-7-6 at 22:59 ] |
4樓2010-07-06 22:54:36
ter20
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9樓2010-07-07 14:02:17
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