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gdpn900至尊木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助/交流】請教clustal 多重序列比對出現(xiàn)的問題 已有3人參與
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現(xiàn)在要將11個氨基酸序列進行比對， 由于這個蛋白的氨基酸序列的N端存在著3段具有較高相似性的重復(fù)序列， 在哺乳動物中發(fā)現(xiàn)的這個蛋白是存在3個這樣的重復(fù)序列，假設(shè)為A、B、C， 在非哺乳動物中目前發(fā)現(xiàn)的僅僅有第三個重復(fù)序列，C， 由于這三個序列存在著相似性，所以將非哺乳動物的序列去和哺乳動物的比對時， 非哺乳動物的C可能和A或者B就開始配對上，而不會對應(yīng)到C上， 這樣一來比對就導致產(chǎn)生與之前一些結(jié)論不同的結(jié)果。 到底該如何解決呢？ 不知道能不能理解清楚我講的意思 |
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2樓2010-07-10 11:53:17
gdpn900
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3樓2010-07-10 12:14:20
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4樓2010-07-12 17:31:00
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5樓2010-07-12 17:38:37
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6樓2010-07-13 00:06:28
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