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飛揚(yáng)886銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助/交流】請(qǐng)教高手核酸序列的位置問題 已有4人參與
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| 請(qǐng)問哪位知道怎樣用生物信息學(xué)方法確定一段核酸序列在整個(gè)基因中的位置,請(qǐng)高手指教,謝謝啦 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
小木蟲職業(yè)打醬油滴~~!
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去NCBI上面BLAST,網(wǎng)址為 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 比對(duì)后,在結(jié)果里面找到相關(guān)的基因組的那條信息,定位! |
銀蟲 (小有名氣)
鐵桿木蟲 (著名寫手)
小木蟲職業(yè)打醬油滴~~!
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你是想知道你的基因大概的位置,如果不想做實(shí)驗(yàn)的話,就可能通過比對(duì),看結(jié)果了,有些比對(duì)結(jié)果序列比你的序列還要短,有可能是相關(guān)的序列,網(wǎng)上的資源太少了,別人只是測(cè)了一小斷,上傳到genbank里面,如果相似度很高的話,一般還是可以相信的,你可以看看和你序列最相近的那條序列在基因組里哪個(gè)位置啊,是干什么用的,還有,如果你的序列是編碼蛋白的話,還可以用NCBI 的ORF FINDER 得到蛋白序列再比,這些都是依據(jù)genbank里面的資源,如果不多就沒辦法了…… |

銀蟲 (小有名氣)
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