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飛揚(yáng)886銀蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
【求助/交流】請(qǐng)教高手核酸序列的位置問(wèn)題 已有4人參與
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| 請(qǐng)問(wèn)哪位知道怎樣用生物信息學(xué)方法確定一段核酸序列在整個(gè)基因中的位置，請(qǐng)高手指教，謝謝啦 |
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2樓2010-07-20 16:49:09
xp198766
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1949stone(金幣+1):謝謝交流 2010-07-20 16:50:59
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1949stone(金幣+1):謝謝交流 2010-07-20 16:50:59
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去NCBI上面BLAST，網(wǎng)址為 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 比對(duì)后，在結(jié)果里面找到相關(guān)的基因組的那條信息，定位！ |
3樓2010-07-20 16:50:34
飛揚(yáng)886
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4樓2010-07-20 17:05:32
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你是想知道你的基因大概的位置，如果不想做實(shí)驗(yàn)的話(huà)，就可能通過(guò)比對(duì)，看結(jié)果了，有些比對(duì)結(jié)果序列比你的序列還要短，有可能是相關(guān)的序列，網(wǎng)上的資源太少了，別人只是測(cè)了一小斷，上傳到genbank里面，如果相似度很高的話(huà)，一般還是可以相信的，你可以看看和你序列最相近的那條序列在基因組里哪個(gè)位置啊，是干什么用的，還有，如果你的序列是編碼蛋白的話(huà)，還可以用NCBI 的ORF FINDER 得到蛋白序列再比，這些都是依據(jù)genbank里面的資源，如果不多就沒(méi)辦法了…… |
5樓2010-07-20 17:24:02
6樓2010-07-20 17:38:01
飛揚(yáng)886
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7樓2010-07-20 17:43:32
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