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【分享】態(tài)密度處理程序
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之前發(fā)過一個簡單版本的態(tài)密度處理程序，這次更新一下。 split_dos.ksh是根據(jù)JMS NRL的腳本改的，其它程序是我自己寫的。 用法：只能在linux系統(tǒng)下，鍵入各個程序名稱運行就可以，如果遇到平臺問題，sumdos程序無法執(zhí)行，可以用 gcc -lm sum.c 編譯源文件產(chǎn)生可執(zhí)行程序。 運行split_dos.ksh會讀取DOSCAR，并生成總的態(tài)密度DOS0和各個原子的各軌道態(tài)密度DOS1~DOSn。（這里注意在計算DOS時INCAR文件里的NEDOS不要設(shè)置為>9999，五位數(shù)的NEDOS值會造成錯誤） 然后運行sumdos可以產(chǎn)生按照特定原子特定軌道模式生成的態(tài)密度和（注意：適用于ISPIN=2的計算結(jié)果，即DOSCAR里面共有有20列數(shù)據(jù)）。 例： sumdos name -t 1 2 3 sumdos是程序名稱，name是一個自定義字符串，會加在生成的文件名里，可以作為說明（但是長度只有8個字符），-t表示生成各個軌道的態(tài)密度和，（還有兩種模式: -n 表示不加和各軌道態(tài)密度，仍舊生成從s到d各個軌道的態(tài)密度； -d 表示把p軌道，eg軌道，t2g軌道各自加和。！！仍然注意，和上次一樣，這里的eg指的是第14、15和18、19列數(shù)據(jù)，t2g是剩下的3列數(shù)據(jù)，如果有各個d軌道不是按照這樣排列的情形則生成的就不是eg和t2g），后面的數(shù)字表示要加和的原子標(biāo)號。上面的例子就是把第1、2、3號原子的所有軌道的態(tài)密度全部加起來。程序支持采用 n~m 形式表示要處理的第n到m個標(biāo)號連續(xù)的原子，例如要處理13到26號原子時，不需要一個一個寫出原子標(biāo)號，只需要寫 13~26 就可以。 附送一個將CONTCAR文件轉(zhuǎn)換為可導(dǎo)入Materials Studio的cif文件的程序，使用很簡單，只需要在linux下，vasp任務(wù)的計算文件夾下，運行exe_Ctocif，程序會自動尋找CONTCAR和POTCAR，并生成cif文件。另外也支持在只有POSCAR文件時轉(zhuǎn)換為cif，但這時需要手動輸入元素名稱。（！！注意：如果是vasp5版本的CONTCAR，請先刪除其中的元素符號那一行。） 例如： exe_Ctocif exe_Ctocif POSCAR Si O 這兩種方式都可以，前一種自動從贗勢里找元素名稱，后一種手動輸入元素名。 http://ishare.iask.sina.com.cn/f/9316742.html [ Last edited by nkleof on 2010-8-16 at 11:10 ] |
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