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zhficcas

銀蟲 (正式寫手)

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[交流] 【求助】在Gaussianview中過渡金屬形成的配位鍵如何表示，就用系統(tǒng)里的單鍵表示嗎？已有4人參與

在Gaussianview中過渡金屬形成的配位鍵如何表示，就用上面的單鍵表示嗎？
還有，我對包含羰基的過度金屬配合物采用b3lyp/lanl2dz（過度金屬），3-21g（其他原子）優(yōu)化后，過渡金屬與羰基的鍵總是變成了雙鍵！原來的構(gòu)型里是單鍵的，一直比較困惑，是輸入文件的問題，還是基組沒有選對，有興趣的蟲蟲指點一下，多謝！

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1樓 2010-10-04 10:54:41

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zhangmt

至尊木蟲 (著名寫手)

我叫MT

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現(xiàn)在的新人進版就開始問問題，既不看高斯說明書，也不看置頂?shù)腇AQ，懶到這種地步啊。。。
樓主請先把置頂?shù)奶覨AQ看完，再提問題吧。

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一群自以為正義凜然的年輕人將一切不能以科學解釋的事情定性為封建迷信并大刀闊斧地進行消滅，其實這是修養(yǎng)不足學識淺薄的一種體現(xiàn)，也是可惡的偏執(zhí)和愚蠢的自以

2樓2010-10-04 11:49:10

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zhficcas

銀蟲 (正式寫手)

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Originally posted by zhangmt at 2010-10-04 11:49:10:
現(xiàn)在的新人進版就開始問問題，既不看高斯說明書，也不看置頂?shù)腇AQ，懶到這種地步啊。。。
樓主請先把置頂?shù)奶覨AQ看完，再提問題吧。

呵呵，多謝提醒！高斯說明書，我下載了一個但沒有對類似的說明，相關(guān)的問題，我在網(wǎng)上也找了幾天了，但都沒有答案，F(xiàn)AQ我先看看，能否解決問題。

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3樓2010-10-04 12:17:04

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yjcmwgk

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4樓2010-10-04 15:58:09

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yjcmwgk

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你用的既然是dft方法，那么，我們明確的告訴您，dft方法中沒有鍵的概念。即使有，也是對dft使用aim或nbo等方法而附加上的概念

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-10-4 at 16:02 ]

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5樓2010-10-04 16:00:01

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zhficcas

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引用回帖:

Originally posted by yjcmwgk at 2010-10-04 16:00:01:
你用的既然是dft方法，那么，我們明確的告訴您，dft方法中沒有鍵的概念。即使有，也是對dft使用aim或nbo等方法而附加上的概念

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-10-4 at 16:02 ]

謝謝提供，您說的我看到了。這里我還有一個在運行高斯時遇到的，不知您有興趣給俺說一下，我用如下輸入文件

#p b3lyp/ gen pseudo=read opt

0 1

分子構(gòu)型如下輸入：
Re
C                1             B1
C                1             B2 2             A1
O                3             B3 1             A2 2             D1
O                2             B4 1             A3 3             D2
Cl                1             B5 2             A4 5             D3
C                1             B6 2             A5 5             D4
C                7             B7 1             A6 2             D5
C                7             B8 1             A7 2             D6
C                7             B9 1             A8 2             D7
C                8          B10 7             A9 1             D8
H                8          B11 7          A10 1             D9
C                9          B12 7          A11 1          D10
C                10          B13 7          A12 1          D11
H                10          B14 7          A13 1          D12
C                11          B15 8          A14 7          D13
H                11          B16 8          A15 7          D14
C                13          B17 9          A16 7          D15
H                14          B18 10          A17 7          D16
H                16          B19 11          A18 8          D17
C                18          B20 13          A19 9          D18
C                13          B21 9          A20 7          D19
H                21          B22 18          A21 13          D20
C                21          B23 18          A22 13          D21
H                22          B24 13          A23 9          D22
H                24          B25 21          A24 18          D23
N                16          B26 11          A25 8          D24
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C                1          B28 2          A27 5          D26
O                29          B29 1          A28 2          D27

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B14          1.08717433
B15          1.41142366
B16          1.08495457
B17          1.42223677
B18          1.08721617
B19          1.08234508
B20          1.42165439
B21          2.35068240
B22          1.08692047
B23          1.39539374
B24          1.08587367
B25          1.08482340
B26          1.35778961
B27          1.34899082
B28          1.97980369
B29          1.17971893
A1          88.46923496
A2          176.41934092
A3          177.27077958
A4          97.81091966
A5          115.53019610
A6          106.01919182
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D7       -179.99620313
D8          0.00000000
D9       -180.00000000
D10       -180.00000000
D11          0.00000000
D12       -180.00000000
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D22          0.00000000
D23       180.00000000
D24          0.00000000
D25          0.00000000
D26       -94.57091976
D27       -58.66339592

1 2 1.0 3 1.0 29 1.0 28 1.0 27 1.0 6 1.0
2 5 2.0
3 4 2.0
4
5
6
7 8 1.5 9 1.5 10 1.5
8 11 1.5 12 1.0
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10 14 2.0 15 1.0
11 16 1.5 17 1.0
12
13 18 1.5 28 1.5
14 18 1.5 19 1.0
15
16 20 1.0 27 1.5
17
18 21 1.5
19
20
21 23 1.0 24 1.5
22 24 1.5 25 1.0 28 1.5
23
24 26 1.0
25
26
27
28
29 30 2.0
30

Re 0
lanl2dz
****
H C N O Cl 0
3-21g
****

Re 0
lanl2dz

這樣輸入，高斯提示無法運行！
然后分子構(gòu)型我采用如下輸入，卻可以，不知道為什么。

Re
C                1             B1
C                1             B2 2             A1
O                3             B3 1             A2 2             D1
O                2             B4 1             A3 3             D2
Cl                1             B5 2             A4 5             D3
C                1             B6 2             A5 5             D4
C                7             B7 1             A6 2             D5
C                7             B8 1             A7 2             D6
C                7             B9 1             A8 2             D7
C                8          B10 7             A9 1             D8
H                8          B11 7          A10 1             D9
C                9          B12 7          A11 1          D10
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C                11          B15 8          A14 7          D13
H                11          B16 8          A15 7          D14
C                13          B17 9          A16 7          D15
H                14          B18 10          A17 7          D16
H                16          B19 11          A18 8          D17
C                18          B20 13          A19 9          D18
C                13          B21 9          A20 7          D19
H                21          B22 18          A21 13          D20
C                21          B23 18          A22 13          D21
H                22          B24 13          A23 9          D22
H                24          B25 21          A24 18          D23
N                16          B26 11          A25 8          D24
N                22          B27 13          A26 9          D25
C                1          B28 2          A27 5          D26
O                29          B29 1          A28 2          D27

B1          1.90343126
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A19       117.46024521
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A21       119.86179783
A22       119.30164209
A23       146.54253809
A24       121.22362404
A25       122.52719023
A26          30.85955052
A27          88.47141497
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6樓2010-10-05 08:15:29

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yjcmwgk

禁蟲 (文壇精英)

密度泛函·小卒

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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流

引用回帖:

這樣輸入，高斯提示無法運行！

錯誤提示是啥呀？

每個新人問問題都會這樣不清楚……

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7樓2010-10-05 11:09:22

已閱回復此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

zhangmt

至尊木蟲 (著名寫手)

我叫MT

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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流

引用回帖:

這樣輸入，高斯提示無法運行！

這里不是說了么？
電腦屏幕中跳出一個叫做高斯的人，用錘子砸了他的頭一下，然后沖著他的耳朵大喊了一句：“無法運行”，然后就死掉了。

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8樓2010-10-05 11:20:11

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zhficcas

銀蟲 (正式寫手)

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引用回帖:

Originally posted by yjcmwgk at 2010-10-05 11:09:22:

錯誤提示是啥呀？

每個新人問問題都會這樣不清楚……

不好意思！
學習中
改正錯誤！

[ Last edited by zhficcas on 2010-10-5 at 15:28 ]

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9樓2010-10-05 11:34:57

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魚妃

金蟲 (著名寫手)

挖坑不填

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★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流

無語了呢……版主快要封你了哈，趕緊把那個可怕的數(shù)字刪掉……別說是我告訴你的哈
原因見量子化學版版規(guī)
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1666402
快刪掉快刪掉
趁著斑竹們還沒看到……

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己所不欲，勿施于人；己所欲者，亦勿施人。無論窮達，但守本分；八風不動，獨善自身。

10樓2010-10-05 11:50:40

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