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Andy8786新蟲 (初入文壇)
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【求助】求高手：怎樣用Jade計(jì)算晶胞參數(shù) 已有4人參與
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| 我現(xiàn)在做的催化劑是鈣鈦礦型催化劑，需要計(jì)算晶胞參數(shù)，不知道怎么算，希望高手指教一下，不勝感激！ |
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Andy8786
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2樓2010-10-16 10:33:42
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4樓2012-11-27 15:07:02
wyf7777
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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大家都很關(guān)注在Jade中如何進(jìn)行晶胞修正的問(wèn)題，實(shí)際上，晶胞修正和指標(biāo)化是結(jié)合在一起的，因此，如果大家不是對(duì)已知晶系很有把握的話，最好在修正之前都預(yù)先進(jìn)行指標(biāo)化以判斷或確證晶系。 在指標(biāo)化之前，大家有幾項(xiàng)工作需預(yù)先進(jìn)行，一是2theta校正（用標(biāo)樣即可）；二是相分析，如果是二相甚至多項(xiàng)共存，則歸屬峰的時(shí)候要非常仔細(xì)。三是峰型擬合確定峰位（如果有重疊峰則更加必要）；我個(gè)人認(rèn)為，指標(biāo)化最關(guān)鍵的一步是確定峰位，選取的峰最好是低角度的獨(dú)立峰，而且選取的峰的數(shù)量并非多多益善，只要滿足了不同的晶系要求即可，遇到重疊峰的時(shí)候一定要小心！ 做好上述工作之后，下一步就是options/pattern indexing，出現(xiàn)一個(gè)面板，在你的晶系前劃勾，然后選擇指標(biāo)化方式，建議是從快（rapid 再下面有2 theat error一欄，如實(shí)填上即可，晶胞參數(shù)最大值最好填的大一點(diǎn)，其它的按默認(rèn)，另外，對(duì)于一些做有機(jī)大分子晶體的朋友來(lái)說(shuō)，晶胞密度可能比較重要，那就要把Z值和化學(xué)式輸入，根據(jù)晶胞體積軟件會(huì)自動(dòng)給出的。 完成上述步驟之后，就“go”吧，軟件會(huì)按照一定的排列方式將很多種可能的結(jié)果一一列出來(lái)，fm值越小，結(jié)果的可信度就越高，有時(shí)會(huì)發(fā)現(xiàn)你認(rèn)為正肯定確的空間群沒(méi)有出現(xiàn)在結(jié)果中，不要緊，在"space group"旁邊有一個(gè)'?'，點(diǎn)擊它一些，看看有沒(méi)有找到，晶體學(xué)上，很多空間群都統(tǒng)屬于同一點(diǎn)群，因此在指標(biāo)化時(shí)，它們都是等同的。當(dāng)你選取其中的一個(gè)指標(biāo)化結(jié)果時(shí)，相應(yīng)的就會(huì)在圖譜上出現(xiàn)一系列黃色的指標(biāo)化的衍射峰位，你可以一一與實(shí)際的衍射位對(duì)應(yīng)，看看結(jié)果是否準(zhǔn)確。有時(shí)一個(gè)結(jié)果也沒(méi)有得到，有可能的原因是選取得峰不對(duì)，2theta偏差不對(duì)，選擇的晶系不對(duì)，也有可能最大晶胞值太小，或者fm截取值太低的緣故。那就重新再來(lái)吧。 接下來(lái)的事情就比較容易了，先選定正確的結(jié)果（藍(lán)），點(diǎn)擊“Refine”，出現(xiàn)“Cell Refinement”的控制面板，再點(diǎn)擊Refine，你就可以得到精確的晶胞參數(shù)，esd表示的是標(biāo)準(zhǔn)偏差。 如果你已知了空間群，并且選峰正確（手動(dòng)），那么你也可以直接“options”/“Cell Refinement”/Refine，打開(kāi)‘reflections'，看看偏差多大，它可以作為指標(biāo)化和晶胞修正的結(jié)果輸出。 |
5樓2012-11-29 15:56:43
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