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ice_rain鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助】關(guān)于vasp進行分子動力學(xué)模擬的求助
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我對分子動力學(xué)一點也不了解,就想模擬一下氧化表面小分子的動力學(xué)行為。(不知道表述清楚不)遇到問題如下 1.POSCAR 中加上Selective dynamics, 除了標記是做動力學(xué)模擬之外,是否有固定原子的作用。 2.由于是氧化表面,分子的吸附對表面影響不是很大,如果能固定個別原子,是否能只讓吸附分子進行優(yōu)化;蛘咦屢粋top layer也relax 3.關(guān)于模擬時間的問題,我沒有做過動力學(xué)模擬的測試,一般的100多個原子的體系,1000步,動力學(xué)要用多少時間(CPU時間)(問題很弱,主要權(quán)衡時間和效果,有沒有必要進行計算)。關(guān)于模擬體系的時間問題,如果是水分子,大約多少ps合適,或者多少步合適。 目前想到這些問題。謝謝大家的幫助。 |
木蟲 (著名寫手)
鷹的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

金蟲 (小有名氣)
木蟲 (著名寫手)
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鐵桿木蟲 (正式寫手)
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