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wenmingfu木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助/交流】求動(dòng)物組織DNA提取方法 已有3人參與
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| 求動(dòng)物組織DNA提取方法 |
DNA檢測(cè) |
金蟲 (正式寫手)
| 看你做的是什么類群的動(dòng)物了。如果是保護(hù)動(dòng)物的話只能取毛發(fā)、糞便、血液這些提取DNA,最好去買個(gè)試劑盒提吧,比如我們這里常用的Axygen的。如果是普通的動(dòng)物,個(gè)體又比較大的話可以直接解剖取組織。我們這里用的是比較原始的酚氯仿方法,直接取樣用剪刀剪碎。一般都用自己配制的裂解緩沖液,具體的配方你可以參考《分子克隆指南》。取一個(gè)火柴頭大小的新鮮樣品(如果是酒精保存的樣品,需要先用雙蒸水脫醇)置于裂解緩沖液中,用干凈的剪刀剪碎,一直剪到看不到明顯的大顆粒,有條件的話也可以用電動(dòng)勻漿器粉碎。組織懸浮液中加入蛋白酶K,于55℃水浴中消化6-8小時(shí)。如果不好消化的時(shí)候也可以消化過夜。但最好不要超過16個(gè)小時(shí)。之后的操作就是經(jīng)典的酚氯仿抽提方法了。第一次加入與消化液等體積的飽和酚,上下顛倒混勻15min,8000rpm離心10min,取上清;第二次向上清中加入1/2體積飽和酚,1/2體積氯仿-異戊醇(貌似比例是13:2,試劑公司有配好的賣),上下顛倒混勻15min,8000rpm離心10min,取上清;要注意不要將上清液和下面的有機(jī)溶劑中間分界線上的白色蛋白質(zhì)吸上來。如果覺得吸上來了可以重復(fù)第二步;第三次向上清中加入等體積氯仿-異戊醇,上下顛倒混勻15min,8000rpm離心10min,取上清。然后向上清液中加入2倍體積無水乙醇或等體積異丙醇沉淀DNA,這步要加NaAc的,具體的量可以看《分子克隆指南》。上下顛倒混勻后加無水乙醇的可以放4℃1小時(shí)或是-20℃ ≥8h充分沉淀。異丙醇可以在室溫靜置1h。之后12000rpm離心,棄上清,用75%乙醇洗滌沉淀后,置于室溫風(fēng)干。最后用雙蒸水溶解就可以了。 |
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Lysis Buffer 1. 100 mM Tris---HCL PH8.3 (50 ml 1M Tris) 2. 500 mM KCL (18.73 g ) 3. 0.1% Gelatin (0.5 g ) 4. 0.45% NP40 (2.25 ml ) 5. 0.45% Tween---20 (2.25 ml ) + H2O =500ml 用的時(shí)候加入PK 水浴55度過夜。第二天100度滅活,冷卻至4度后可以直接進(jìn)行PCR鑒定 |

木蟲 (正式寫手)
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1. 組織樣品和培養(yǎng)細(xì)胞的裂解 (1)組織樣品 ① 將lg新鮮切取的組織在液氮中速凍,并用液氮預(yù)冷的研缽研磨。 ② 液氮揮發(fā),將組織粉末一點(diǎn)一點(diǎn)地加入盛有10倍體積裂解液的燒杯中,使其分散于裂解液表面,后振搖燒杯使粉末浸沒。 ③ 將懸液轉(zhuǎn)移至50ml三角瓶中,并于37℃溫育1h,立即進(jìn)行步驟1.2.。 (2)培養(yǎng)細(xì)胞 ①單層培養(yǎng)細(xì)胞 i.從孵箱中取出長滿單層細(xì)胞的培養(yǎng)皿,迅速吸去培養(yǎng)液,用冰冷的TBS洗2次,加入1ml新鮮的冰冷的TBS。 ii. 用橡膠刮棒將細(xì)胞刮入1ml TBS中,用吸管將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移到冰上的離心管中。用0.5 ml冰冷的TBS沖洗培養(yǎng)皿,后并入離心管的細(xì)胞懸液。 iii.于4℃3000r/min離心10min以收集細(xì)胞。 iv. 將細(xì)胞重懸于5倍~10倍體積的冰冷TBS中并再度離心。 v. 用1 ml TE(PH8.0)重新懸浮細(xì)胞,轉(zhuǎn)移至50 ml三角瓶中。 vi. 每毫升細(xì)胞懸液加10 ml裂解緩沖液,于37℃溫育1h,立即進(jìn)行步驟1.2.。 ②懸浮培養(yǎng)的細(xì)胞 i.將細(xì)胞轉(zhuǎn)移至離心管,于4℃3000r/min離心10min以收集細(xì)胞,吸去上清。 ii.用1倍體積冰冷的TBS重懸細(xì)胞并再度離心,吸去上清,小心地再次重懸細(xì)胞于冰冷的TBS中,離心收集細(xì)胞。 iii.去上清,用1ml TE(PH8.0)重新懸浮細(xì)胞,轉(zhuǎn)移至50 ml三角瓶中。 iv.每毫升細(xì)胞懸液加10 ml裂解緩沖液,于37℃溫育1h,立即進(jìn)行步驟1.2.。 2.將裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,裂解液不能超過1/3體積。 3.加入蛋白酶K(20mg/ml)至終濃度100µg/ml。用一滅菌玻璃棒溫和地將酶混入細(xì)胞裂解液中。 4.將細(xì)胞裂解液置于50℃水浴中保溫3 h,并不時(shí)振搖。 5.將溶液冷卻至室溫,加入等體積的平衡酚,將離心管置于渦旋器上,使離心管緩慢顛轉(zhuǎn)10min 以溫和地混合兩相。 6.室溫下,6500r/min離心15 min以分離兩相。 7.用寬口移液管將黏滯的水相轉(zhuǎn)移至另一離心管。 8.苯酚抽提兩次,收集水相。 9.加入0.2倍體積10mol/L醋酸銨及2倍體積無水乙醇,旋轉(zhuǎn)離心管直至溶液徹底混勻?yàn)橹埂? 10.DNA隨即形成沉淀,在室溫下6500r/min離心5 min,收集沉淀。 11.用70%乙醇洗滌DNA沉淀2次,按步驟1.10.離心收集DNA。 12.盡可能吸去殘余乙醇,于室溫下,將DNA沉淀置于敞開的管內(nèi),直至乙醇揮發(fā)殆盡。 13.按每0.1m1細(xì)胞(步驟1.1)加入1ml TE溶解DNA,將DNA溶液儲(chǔ)存于4℃。 14.用紫外分光光度法或二苯胺顯色法檢測(cè)DNA含量。詳見本實(shí)驗(yàn)第二部分。 |
木蟲 (正式寫手)
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