 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1136 | 回復(fù): 1 | ||||
maomao-666木蟲(chóng) (小有名氣)
|
[交流]
【求助】siesta中PDOS文件的處理
|
| 請(qǐng)教高手，如題，在siesta中怎么處理PDOS文件！ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專(zhuān)輯推薦
 siesta問(wèn)題 |
» 猜你喜歡
290求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
一志愿中南化學(xué)（0703）總分337求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
北科281學(xué)碩材料求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求調(diào)劑一志愿南京航空航天大學(xué)289分
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
A區(qū)線材料學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
材料學(xué)碩297已過(guò)四六級(jí)求調(diào)劑推薦
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
316求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿西南交通 專(zhuān)碩 材料355 本科雙非 求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿武漢理工材料工程專(zhuān)碩調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
329求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- siesta-3.1編譯成功，但有幾個(gè)問(wèn)題求助
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 求助Siesta計(jì)算熟手，想學(xué)習(xí)此軟件
已經(jīng)有8人回復(fù)
- SIESTA中能帶文件*.bands的處理
已經(jīng)有49人回復(fù)
- origin 做DOS 圖
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】H2 Binding Energy@SIESTA
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教在ATK中怎樣使用自己的或者Siesta的贗勢(shì)
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】siesta輸入文件中贗勢(shì)文件的作用？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】siesta2.0.2 安裝有些警告
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】如何用origin做pdos圖!
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】siesta3.0 安裝，錯(cuò)誤一籮筐
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】siesta中transiesta模塊的收斂標(biāo)準(zhǔn)是啥~~
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教siesta3.0-beta如何計(jì)算PDOS、overlap population及coop
已經(jīng)有12人回復(fù)
» 搶金幣啦！回帖就可以得到:
-
農(nóng)業(yè)信息工程技術(shù)（專(zhuān)碩）招收調(diào)劑 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)
+1/185
-
南京醫(yī)科大學(xué)生殖醫(yī)學(xué)與子代健康國(guó)重實(shí)驗(yàn)室-董飛宏課題組-學(xué)術(shù)碩士招生
+1/95
-
海南大學(xué)化工院生物質(zhì)定向轉(zhuǎn)化課題組招收博士/碩士，2026年9月入學(xué)
+1/83
-
浙江農(nóng)林大學(xué)招收調(diào)劑
+1/79
-
愿遇見(jiàn)你，遇見(jiàn)不止擦肩而過(guò)的緣分
+1/74
-
飄在美國(guó)，有點(diǎn)想家
+1/53
-
0854電子信息調(diào)劑，閩南師大光電芯片研發(fā)實(shí)驗(yàn)室，柯少穎教授課題組，集成電路
+1/36
-
湘潭大學(xué)“過(guò)程強(qiáng)化與綠色化工”創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)補(bǔ)招2026年秋入學(xué)博士生
+1/35
-
催化方向推薦一個(gè)極好的博導(dǎo)
+1/34
-
西安某大學(xué)能源化工新材料研發(fā)項(xiàng)目組接收2026級(jí)調(diào)劑研究生-計(jì)算機(jī)類(lèi)
+1/34
-
上海交通大學(xué)電催化方向博后招聘-有鋰電、高分子、燃料電池背景者優(yōu)先
+1/31
-
南京理工大學(xué)優(yōu)青團(tuán)隊(duì)招聘副教授、博士后、博士、碩士生（化學(xué)、催化方向）
+1/31
-
---大齡的未婚男找結(jié)婚女對(duì)象
+1/18
-
211/雙一流---石河子大學(xué)---有機(jī)化學(xué)方向招調(diào)劑生
+1/7
-
香港大學(xué)David Srolovitz教授課題組招聘「香江學(xué)者」博士后
+1/6
-
【武漢高校】【新能源材料與器件課題組】 招收優(yōu)秀碩士調(diào)劑生�。�！
+5/5
-
華中科技大學(xué)管理學(xué)院招聘社會(huì)用工（科研助理）1名
+1/5
-
上海交通大學(xué)機(jī)械與動(dòng)力工程學(xué)院博士后招聘
+3/2
-
上海交通大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院張智濤課題組誠(chéng)聘博士后
+1/1
-
武漢輕工大學(xué)土木水利青椒碩導(dǎo)招調(diào)劑
+1/1
xiaochun37
鐵蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 206.7
- 帖子: 19
- 在線: 1.6小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1121966
★ ★ ★ ★
cenwanglai(金幣+2):謝謝回復(fù)！ 2010-11-10 17:33:18
sunyang1988(金幣+2):呵呵，辛苦了 2010-11-10 19:00:47
maomao-666(金幣+5): 2010-11-10 19:03:48
cenwanglai(金幣+2):謝謝回復(fù)！ 2010-11-10 17:33:18
sunyang1988(金幣+2):呵呵，辛苦了 2010-11-10 19:00:47
maomao-666(金幣+5): 2010-11-10 19:03:48
|
百度來(lái)的哈~~ 一： pdosxm 我主要參考的http://fisica.ehu.es/ag/siesta-extra/issues.html 使得siesta輸出的PDOS文件中沒(méi)有＊。 另外對(duì)于nspin=2的情況，修改了pdosxml的代碼，使得其能用。 （1） 在arch.make中加入 FPPFLAGS= -DWXML_INIT_FIX $make clean , $make 這樣siesta輸出的PDOS文件中就沒(méi)有＊。 （2）推薦使用/Util/pdosxml，來(lái)讀取PDOS文件，并轉(zhuǎn)化成gnuplot能處理的形式 使用參見(jiàn)/Util/pdosxml/README 主要步驟如下: 1 在m_orbital_chooser.f90 中選好你要的軌道 2 make 3 ./pdos h2o_dos.PDOS >out 采用原來(lái)的代碼，計(jì)算nspin=2時(shí)會(huì)出錯(cuò)，http://fisica.ehu.es/ag/siesta-extra/issues.html給出的 m_pdos.f90文件 其實(shí)和原來(lái)的一樣。我們要自己改一下代碼 在 m_pdos.f90 大概150多行的地方： if (spin_polarized) then dos1 = dos1 + data(1:ndata:2) dos2 = dos2 + data(2:ndata:2) else dos1 = dos1 + data endif ｜｜ 替換成 ｜｜ ｜｜ \ / if (spin_polarized) then !shanghui add here to make nspin=2's pdos do i=1,ndata/2 dos1(i) = dos1(i) + data(2*i-1) dos2(i) = dos2(i) - data(2*i) enddo !shanghui end add here else dos1 = dos1 + data endif 這樣你就能做出正負(fù)分開(kāi)的PDOS了。 上面修改好的siesta放在 cluster4 /public/soft/siesta/siesta_Util_pdosxml 二 ： readpdos 我寫(xiě)的一個(gè)小代碼，放在 210.45.121.200 ~/share/Seminar_backup/siesta_tutorial/soft_siesta/readpdos 可以對(duì)有＊號(hào)的PDOS文件都能處理，但是每次體系，都要重新修改代碼 |
2樓2010-11-10 17:30:45
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 maomao-666 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿南京航空航天大學(xué)289分 +3 | @taotao 2026-03-19 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | Mqqqqqq 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
[考研] 086500 325 求調(diào)劑 +3 | 領(lǐng)帶小熊 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +8 | 梁梁校校 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 286分人工智能專(zhuān)業(yè)請(qǐng)求調(diào)劑愿意跨考！ +3 | lemonzzn 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +15 | 于海海海海 2026-03-19 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 復(fù)試調(diào)劑 +4 | z1z2z3879 2026-03-14 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +6 | lemonzzn 2026-03-16 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +11 | 冬十三 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，求調(diào)劑 +4 | 材化逐夢(mèng)人 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +10 | 呼呼呼。。。。 2026-03-17 | 10/500 |
|
|
|
[考研]
 0854，計(jì)算機(jī)類(lèi)招收調(diào)劑
+3
|
胡辣湯放糖 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)071000 329分求調(diào)劑 +3 | 我愛(ài)生物生物愛(ài)?/a> 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)336分求調(diào)劑 +6 | zbzihdhd 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 334求調(diào)劑 +3 | 志存高遠(yuǎn)意在機(jī)?/a> 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 277調(diào)劑 +5 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +3 | 曼殊2266 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 26考研一志愿中國(guó)石油大學(xué)(華東)305分求調(diào)劑 +3 | 嘉年新程 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 070305求調(diào)劑 +3 | mlpqaz03 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 297一志愿上交085600求調(diào)劑 +5 | 指尖八千里 2026-03-14 | 5/250 |
|