 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1137 | 回復(fù): 1 | ||||
[交流]
【求助】siesta中PDOS文件的處理
|
| 請(qǐng)教高手，如題，在siesta中怎么處理PDOS文件！ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 siesta問題 |
» 猜你喜歡
【考研調(diào)劑】化學(xué)專業(yè) 281分，一志愿四川大學(xué)，誠(chéng)心求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
一志愿華南師大 070300（化學(xué)）304分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境專碩，總分308求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
354求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿西南交大，求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
299求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
材料專業(yè)求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- siesta-3.1編譯成功，但有幾個(gè)問題求助
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 求助Siesta計(jì)算熟手，想學(xué)習(xí)此軟件
已經(jīng)有8人回復(fù)
- SIESTA中能帶文件*.bands的處理
已經(jīng)有49人回復(fù)
- origin 做DOS 圖
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】H2 Binding Energy@SIESTA
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教在ATK中怎樣使用自己的或者Siesta的贗勢(shì)
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】siesta輸入文件中贗勢(shì)文件的作用？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】siesta2.0.2 安裝有些警告
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】如何用origin做pdos圖!
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】siesta3.0 安裝，錯(cuò)誤一籮筐
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】siesta中transiesta模塊的收斂標(biāo)準(zhǔn)是啥~~
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教siesta3.0-beta如何計(jì)算PDOS、overlap population及coop
已經(jīng)有12人回復(fù)
» 搶金幣啦！回帖就可以得到:
-
坐標(biāo)上海，誠(chéng)征女友，非常 著急，私信必回
+1/462
-
浙江大學(xué)侯陽(yáng)教授團(tuán)隊(duì)誠(chéng)聘博士后---高性能固態(tài)電解質(zhì)與固態(tài)電池器件設(shè)計(jì)
+1/84
-
招收材料與化學(xué)相關(guān)專業(yè)碩士研究生
+1/83
-
愿遇見你，遇見不止擦肩而過的緣分
+1/74
-
西北大學(xué)化學(xué)與材料科學(xué)學(xué)院博士招生（還有兩個(gè)名額，3月30日截至）
+1/63
-
PBAT溶解做成乳液
+1/39
-
招收熒光探針/有機(jī)合成/生物學(xué) 博士后--薪金: 30萬(wàn)-50萬(wàn)
+1/34
-
中山大學(xué)院士團(tuán)隊(duì)微納器件、腦機(jī)接口方向博士招生、博后招聘
+1/18
-
招聘科研助理——儲(chǔ)能方向（儲(chǔ)能、流體傳熱、CFD模擬）
+1/17
-
寧波東方理工大學(xué)余鵬課題組2026年上海交大聯(lián)培博士生、博士后、科研助理招聘
+1/17
-
---大齡的未婚男找結(jié)婚女對(duì)象
+1/16
-
湖南大學(xué)微生物結(jié)構(gòu)與功能實(shí)驗(yàn)室2026年計(jì)劃招收博士研究生
+1/15
-
26年博士自薦
+1/14
-
青島科技大學(xué)化工學(xué)院院士團(tuán)隊(duì)2026年擬招收全日制博士研究生1名
+1/9
-
【博士招生】武漢科技大學(xué)招收材料、化工、環(huán)境、冶金類2026年“申請(qǐng)-考核”制博士生
+1/7
-
青島科技大學(xué)可持續(xù)高分子團(tuán)隊(duì) 考研招生
+1/6
-
26年申博自薦-計(jì)算機(jī)視覺
+1/5
-
歡迎生物與醫(yī)藥、藥學(xué)、化學(xué)等相關(guān)專業(yè)的同學(xué)
+1/4
-
西安交通大學(xué)生命學(xué)院智能化診療裝備研究中心2026年博士生招生
+1/1
-
“機(jī)械、材料”招生
+1/1
★ ★ ★ ★
cenwanglai(金幣+2):謝謝回復(fù)！ 2010-11-10 17:33:18
sunyang1988(金幣+2):呵呵，辛苦了 2010-11-10 19:00:47
maomao-666(金幣+5): 2010-11-10 19:03:48
cenwanglai(金幣+2):謝謝回復(fù)！ 2010-11-10 17:33:18
sunyang1988(金幣+2):呵呵，辛苦了 2010-11-10 19:00:47
maomao-666(金幣+5): 2010-11-10 19:03:48
|
百度來(lái)的哈~~ 一： pdosxm 我主要參考的http://fisica.ehu.es/ag/siesta-extra/issues.html 使得siesta輸出的PDOS文件中沒有＊。 另外對(duì)于nspin=2的情況，修改了pdosxml的代碼，使得其能用。 （1） 在arch.make中加入 FPPFLAGS= -DWXML_INIT_FIX $make clean , $make 這樣siesta輸出的PDOS文件中就沒有＊。 （2）推薦使用/Util/pdosxml，來(lái)讀取PDOS文件，并轉(zhuǎn)化成gnuplot能處理的形式 使用參見/Util/pdosxml/README 主要步驟如下: 1 在m_orbital_chooser.f90 中選好你要的軌道 2 make 3 ./pdos h2o_dos.PDOS >out 采用原來(lái)的代碼，計(jì)算nspin=2時(shí)會(huì)出錯(cuò)，http://fisica.ehu.es/ag/siesta-extra/issues.html給出的 m_pdos.f90文件 其實(shí)和原來(lái)的一樣。我們要自己改一下代碼 在 m_pdos.f90 大概150多行的地方： if (spin_polarized) then dos1 = dos1 + data(1:ndata:2) dos2 = dos2 + data(2:ndata:2) else dos1 = dos1 + data endif ｜｜ 替換成 ｜｜ ｜｜ \ / if (spin_polarized) then !shanghui add here to make nspin=2's pdos do i=1,ndata/2 dos1(i) = dos1(i) + data(2*i-1) dos2(i) = dos2(i) - data(2*i) enddo !shanghui end add here else dos1 = dos1 + data endif 這樣你就能做出正負(fù)分開的PDOS了。 上面修改好的siesta放在 cluster4 /public/soft/siesta/siesta_Util_pdosxml 二 ： readpdos 我寫的一個(gè)小代碼，放在 210.45.121.200 ~/share/Seminar_backup/siesta_tutorial/soft_siesta/readpdos 可以對(duì)有＊號(hào)的PDOS文件都能處理，但是每次體系，都要重新修改代碼 |
2樓2010-11-10 17:30:45
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 maomao-666 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料專碩英一數(shù)二306 +7 | z1z2z3879 2026-03-18 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 294求調(diào)劑材料與化工專碩 +15 | 陌の森林 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 323求調(diào)劑 +3 | 洼小桶 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +16 | 于海海海海 2026-03-19 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +5 | 申子申申 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 316求調(diào)劑 +5 | 梁茜雯 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交通 專碩 材料355 本科雙非 求調(diào)劑 +5 | 西南交通專材355 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0817 化學(xué)工程 299分求調(diào)劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章 +22 | rare12345 2026-03-18 | 22/1100 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué)0703化學(xué)318分，有科研經(jīng)歷，求調(diào)劑 +4 | 一瓶苯甲酸 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿 南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩 +5 | @taotao 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +7 | 困于星晨 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 招收調(diào)劑碩士 +4 | lidianxing 2026-03-19 | 12/600 |
|
|
|
[論文投稿]
申請(qǐng)回稿延期一個(gè)月，編輯同意了。但系統(tǒng)上的時(shí)間沒變，給編輯又寫郵件了，沒回復(fù)
10+3
|
wangf9518 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +9 | 冷笙123 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 324分 085600材料化工求調(diào)劑 +3 | llllkkkhh 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語(yǔ)六級(jí)551，有科研經(jīng)歷 +3 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +6 | 26研0 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 280求調(diào)劑 +6 | 咕嚕曉曉 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +4 | 睿08 2026-03-17 | 6/300 |
|