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cg陳鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助】體系的minimizer 目的是什么？ 已有5人參與
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跟朋友討論這個(gè)minimizer這個(gè)問題 我們對(duì)晶體、分子單個(gè)都是最小化的 但對(duì)于將二者放到一個(gè)體系中時(shí) 是不是先要最小化 出現(xiàn)了分歧 比如 分子在某個(gè)晶體某個(gè)面的吸附過程的體系 我一直都是先最小化的 目的就是讓體系能量處于最低點(diǎn) 使得體系穩(wěn)定 然后再dynamic 但我的朋友卻這么做 他先dynamic 如果出錯(cuò)了 就minimizer 他認(rèn)為 dynamic就是一個(gè)體系逐漸穩(wěn)定過程 根據(jù)模擬的時(shí)間長短 找到相對(duì)平衡的模擬結(jié)果 所以之前的minimize 不是必須的 我想自己對(duì)于分子模擬的本質(zhì)還是不太清楚 我想請(qǐng)教下大家 MM是不是必須的？ |
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2樓2010-11-13 08:57:01
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3樓2010-11-13 10:27:52
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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
sunyang1988(金幣+2):謝謝交流 2010-11-13 23:46:39
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
sunyang1988(金幣+2):謝謝交流 2010-11-13 23:46:39
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你老師說的對(duì)，最小化不是說作動(dòng)力學(xué)必須的。一般最小化是首先達(dá)到一個(gè)合理的結(jié)構(gòu)，然后動(dòng)力學(xué)的話更容易達(dá)到穩(wěn)定狀態(tài)。有時(shí)候不最小化的時(shí)候，計(jì)算動(dòng)力學(xué)會(huì)出錯(cuò)，提醒你兩步之間的能量差超過了設(shè)定的值。這時(shí)候最小化一下，就不會(huì)出現(xiàn)這個(gè)問題了。所以說最小化不是必須要做的。動(dòng)力學(xué)自己計(jì)算是會(huì)達(dá)到穩(wěn)定的狀態(tài)的。 |
5樓2010-11-13 21:44:20
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6樓2010-11-13 22:41:24
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