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hustyh0801

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[交流] 【求助】一個(gè)結(jié)構(gòu)優(yōu)化的問(wèn)題

本人新手，想問(wèn)一下大家。再利用Gaussian03優(yōu)化分子的幾何結(jié)構(gòu)時(shí)，要預(yù)先對(duì)分子進(jìn)行怎樣的預(yù)處理？我們現(xiàn)在的做法是通過(guò)CHEM3D里邊的MM2對(duì)分子進(jìn)行預(yù)優(yōu)化，然后再把優(yōu)化好的坐標(biāo)輸入到Gaussian03中做下一步的優(yōu)化，如果沒(méi)有這一步直接用Gaussian進(jìn)行優(yōu)化，得到的結(jié)果二者有什么區(qū)別？請(qǐng)各位大俠指教，xiexie！��！

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1樓 2010-11-20 09:51:51

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fatpig8832

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heyo_123(金幣+1):鼓勵(lì)交流�。� 2010-11-20 10:32:46

預(yù)優(yōu)化的作用就是有可能會(huì)節(jié)省時(shí)間...因?yàn)檎f(shuō)不定你預(yù)優(yōu)化出來(lái)的結(jié)構(gòu)跟g03得到的結(jié)構(gòu)很接近，那g03很快就能算完...

但并不是每次都這樣...

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3樓2010-11-20 10:18:24

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heyo_123

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Originally posted by hustyh0801 at 2010-11-20 09:51:51:
本人新手，想問(wèn)一下大家。再利用Gaussian03優(yōu)化分子的幾何結(jié)構(gòu)時(shí)，要預(yù)先對(duì)分子進(jìn)行怎樣的預(yù)處理？我們現(xiàn)在的做法是通過(guò)CHEM3D里邊的MM2對(duì)分子進(jìn)行預(yù)優(yōu)化，然后再把優(yōu)化好的坐標(biāo)輸入到Gaussian03中做下一步的優(yōu)化 ...

要看分子的大小，是否還金屬。區(qū)別？？自己輸個(gè)分子試試不就得了.

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2樓2010-11-20 10:15:23

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hustyh0801

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Originally posted by heyo_123 at 2010-11-20 10:15:23:

要看分子的大小，是否還金屬。區(qū)別？？自己輸個(gè)分子試試不就得了.

分子不大9個(gè)原子，另外也不含金屬，我們想重復(fù)別人的數(shù)據(jù)但是我們得出的結(jié)果與別人相差較大，方法和基組都是一樣的，我們?cè)谙胧遣皇穷A(yù)優(yōu)化的問(wèn)題，另外我們也分別比較過(guò)不預(yù)優(yōu)化與預(yù)優(yōu)化后的優(yōu)化結(jié)果還是有一定的差別，一開(kāi)始我的理解也是預(yù)優(yōu)化只是為了節(jié)省Gaussian計(jì)算時(shí)間，但是后來(lái)發(fā)現(xiàn)結(jié)果還是。。。。。請(qǐng)版主賜教！��！

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4樓2010-11-20 10:46:21

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引用回帖:

Originally posted by hustyh0801 at 2010-11-20 10:46:21:

分子不大9個(gè)原子，另外也不含金屬，我們想重復(fù)別人的數(shù)據(jù)但是我們得出的結(jié)果與別人相差較大，方法和基組都是一樣的，我們?cè)谙胧遣皇穷A(yù)優(yōu)化的問(wèn)題，另外我們也分別比較過(guò)不預(yù)優(yōu)化與預(yù)優(yōu)化后的優(yōu)化結(jié)果還是有一定 ...

不要用MM2了，直接用gaussian算。先低基組優(yōu)化結(jié)構(gòu)，后高級(jí)組算能量。你懂的。

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5樓2010-11-20 11:26:14

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