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【求助】求博士論——文分子對接在藥物設(shè)計中的應(yīng)用
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上海藥物所陳凱先，蔣華良的博士研究生羅小民的博士論文 藥物設(shè)計新手的導(dǎo)讀首選材料 目 錄 文摘 英文文摘 第一章 分子對接及其在藥物設(shè)計中的應(yīng)用 1.1引言 1.2分子對接法的基本原理 1.3Docking 1.4DOCK 1.4.1形狀匹配 1.4.2分而治之的匹配算法 1.4.3基于經(jīng)驗勢能函數(shù)的評價函數(shù) 1.4.4柔性對接 1.5AutoDock 1.5.1評價函數(shù) 1.5.2柔性搜尋方法 1.6FlexX 1.6.1FlexX對化學(xué)現(xiàn)象的模擬 1.6.2對接算法 1.7FlexiDock 1.7.1FlexiDock預(yù)處理 1.7.2FlexiDock中的遺傳算法 1.8分子對接在藥物設(shè)計中的應(yīng)用 1.8.1 HIV-1蛋白酶 1.8.2胸苷酸合成酶 1.8.3流行感冒血凝素 1.8.4寄生蟲蛋白酶 1.9結(jié)語 參考文獻 第二章 酪氨酸激酶抑制劑的分子設(shè)計及其與酪氨酸激酶的作用機理研究 2.1引言 2.2研究方法 2.3結(jié)果與討論 2.3.1 DOCK 4.0能量與Sybyl分子力學(xué)能量特征 2.3.2分子結(jié)構(gòu)特征 2.4藥理測試 2.5結(jié)論 參考文獻 第三章 乙酰膽堿酯酶抑制劑的數(shù)據(jù)庫搜尋及其與乙酰膽堿酯酶的作用機理研究 3.1引言 3.2石杉堿甲衍生物與乙酰膽堿酯酶的作用機理 3.2.1研究方法 3.2.2結(jié)果與討論 3.2.3小結(jié) 3.3利用三維藥效基團搜尋以及分子對接方法尋找新型乙酰膽堿酯酶抑制劑 3.3.1研究方法 3.3.2結(jié)果與討論 3.4利用分子對接方法從天然產(chǎn)物中搜尋乙酰膽堿酯酶抑制劑先導(dǎo)化合物 3.4.1研究方法 3.4.2結(jié)果與討論 3.4.3小結(jié) 3.5結(jié)論 參考文獻 第四章 白樺子酸及齊墩果酸類抗HIV試劑的定量構(gòu)效關(guān)系研究 4.1引言 4.2研究方法 4.3結(jié)果與討論 4.4結(jié)論 參考文獻 第五章 分子對接程序DOCK 4.0在國產(chǎn)超級計算機上的并行化 5.1引言 5.2程序移植及并行化 5.3結(jié)果及討論 5.3.1神威超級計算機，DEC alpha工作站計算結(jié)果與SGI 工作站計算結(jié)果比較 5.3.2并行分子對接的效率 5.3.3今后改進的方向 5.4結(jié)論 參考文獻 Selected Publication 論壇里誰有這篇論文嗎？可否共享下，最近課題需要做dock，急需protocol，謝謝啊。 |
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2樓2010-12-01 07:58:05
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恩，因為我是初學(xué)者，所以想了解一些基本的原理，這些應(yīng)該不會有太大的變化的。 請問，你有這個論文嗎？如果有，可以發(fā)我一份嗎？ wangqiustc@gmail.com |
3樓2010-12-01 09:17:17
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zh1987hs(金幣+5):謝謝 2010-12-01 11:28:09
sibsqq(金幣+10):謝謝你的提供，雖然我已經(jīng)找到了，還是兌現(xiàn)獎勵，以后多切磋，呵呵。 2010-12-01 20:04:54
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sibsqq(金幣+10):謝謝你的提供，雖然我已經(jīng)找到了，還是兌現(xiàn)獎勵，以后多切磋，呵呵。 2010-12-01 20:04:54
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10樓2012-03-23 16:07:36
簡單回復(fù)
2011-05-04 16:46
回復(fù)
謝謝分享
ghlsx11樓
2015-07-31 00:34
回復(fù)
好
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