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【求助】求博士論——文分子對(duì)接在藥物設(shè)計(jì)中的應(yīng)用
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上海藥物所陳凱先,蔣華良的博士研究生羅小民的博士論文 藥物設(shè)計(jì)新手的導(dǎo)讀首選材料 目 錄 文摘 英文文摘 第一章 分子對(duì)接及其在藥物設(shè)計(jì)中的應(yīng)用 1.1引言 1.2分子對(duì)接法的基本原理 1.3Docking 1.4DOCK 1.4.1形狀匹配 1.4.2分而治之的匹配算法 1.4.3基于經(jīng)驗(yàn)勢(shì)能函數(shù)的評(píng)價(jià)函數(shù) 1.4.4柔性對(duì)接 1.5AutoDock 1.5.1評(píng)價(jià)函數(shù) 1.5.2柔性搜尋方法 1.6FlexX 1.6.1FlexX對(duì)化學(xué)現(xiàn)象的模擬 1.6.2對(duì)接算法 1.7FlexiDock 1.7.1FlexiDock預(yù)處理 1.7.2FlexiDock中的遺傳算法 1.8分子對(duì)接在藥物設(shè)計(jì)中的應(yīng)用 1.8.1 HIV-1蛋白酶 1.8.2胸苷酸合成酶 1.8.3流行感冒血凝素 1.8.4寄生蟲蛋白酶 1.9結(jié)語 參考文獻(xiàn) 第二章 酪氨酸激酶抑制劑的分子設(shè)計(jì)及其與酪氨酸激酶的作用機(jī)理研究 2.1引言 2.2研究方法 2.3結(jié)果與討論 2.3.1 DOCK 4.0能量與Sybyl分子力學(xué)能量特征 2.3.2分子結(jié)構(gòu)特征 2.4藥理測(cè)試 2.5結(jié)論 參考文獻(xiàn) 第三章 乙酰膽堿酯酶抑制劑的數(shù)據(jù)庫(kù)搜尋及其與乙酰膽堿酯酶的作用機(jī)理研究 3.1引言 3.2石杉?jí)A甲衍生物與乙酰膽堿酯酶的作用機(jī)理 3.2.1研究方法 3.2.2結(jié)果與討論 3.2.3小結(jié) 3.3利用三維藥效基團(tuán)搜尋以及分子對(duì)接方法尋找新型乙酰膽堿酯酶抑制劑 3.3.1研究方法 3.3.2結(jié)果與討論 3.4利用分子對(duì)接方法從天然產(chǎn)物中搜尋乙酰膽堿酯酶抑制劑先導(dǎo)化合物 3.4.1研究方法 3.4.2結(jié)果與討論 3.4.3小結(jié) 3.5結(jié)論 參考文獻(xiàn) 第四章 白樺子酸及齊墩果酸類抗HIV試劑的定量構(gòu)效關(guān)系研究 4.1引言 4.2研究方法 4.3結(jié)果與討論 4.4結(jié)論 參考文獻(xiàn) 第五章 分子對(duì)接程序DOCK 4.0在國(guó)產(chǎn)超級(jí)計(jì)算機(jī)上的并行化 5.1引言 5.2程序移植及并行化 5.3結(jié)果及討論 5.3.1神威超級(jí)計(jì)算機(jī),DEC alpha工作站計(jì)算結(jié)果與SGI 工作站計(jì)算結(jié)果比較 5.3.2并行分子對(duì)接的效率 5.3.3今后改進(jìn)的方向 5.4結(jié)論 參考文獻(xiàn) Selected Publication 論壇里誰有這篇論文嗎?可否共享下,最近課題需要做dock,急需protocol,謝謝啊。 |
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恩,因?yàn)槲沂浅鯇W(xué)者,所以想了解一些基本的原理,這些應(yīng)該不會(huì)有太大的變化的。 請(qǐng)問,你有這個(gè)論文嗎?如果有,可以發(fā)我一份嗎? wangqiustc@gmail.com |
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