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[交流] 【求助】蟲友們對ISIF取值有什么高見呢

蟲友們對ISIF取值有什么高見呢，官方說明上說，ISIF大于4時，離子不持豫，我一直認(rèn)為優(yōu)化就是改變離子的位置，使我們的結(jié)構(gòu)更好，離子都保持不動了，還優(yōu)化什么啊，而且這些值一般怎么取呢

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1樓 2010-12-07 09:20:57

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好問題

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2樓2010-12-07 09:34:02

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first_yg

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★ ★
ellsaking(金幣+2):謝謝詳細(xì)說明，歡迎常來~ 2010-12-07 10:05:28

看來新手的問題都差不多呵，這幾天看了你的幾個帖子，都是我也曾經(jīng)或正在疑惑的問題。
不過我的ISIF最終只能用2了，因為我算的石墨烯表面，看過以前侯博士一個回帖，像這樣的低維表面不適合將Z方向體積也優(yōu)化，會導(dǎo)致真空層減少很多。我試了一下3，確實如此。
但是文獻中提到當(dāng)分子原子吸附于石墨烯表面，濃度很大時，石墨烯晶格會有很大變化。我一度很困惑，那么到底我該怎么辦。
最近看了幾篇文章，發(fā)現(xiàn)是將整個吸附體系作為晶格常數(shù)優(yōu)化的對象，而不是單純依靠ISIF來計算。覺得這樣的方法也不錯，就是有些耗時。
啰嗦了這么多，是把最近的心得說出來，不知道對你有沒有用。呵呵。

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3樓2010-12-07 09:58:08

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gavinliu7390

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★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
ellsaking(金幣+2):謝謝指點~ 2010-12-07 10:54:44

優(yōu)化分兩種，一種是優(yōu)化離子位置，以保證每個離子的受力趨于0. 二是優(yōu)化晶格基矢，以使得三個主軸的stress相等，趨于一個值，而非對角元的stress趨于0，沒有剪切力。

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4樓2010-12-07 10:45:17

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Originally posted by gavinliu7390 at 2010-12-07 10:45:17:
優(yōu)化分兩種，一種是優(yōu)化離子位置，以保證每個離子的受力趨于0. 二是優(yōu)化晶格基矢，以使得三個主軸的stress相等，趨于一個值，而非對角元的stress趨于0，沒有剪切力。

ISIF大于4時，說明上說得是離子不持豫，
如果改變基矢或者優(yōu)化離子位置都會改變你原胞中原子的位置啊，
我一直認(rèn)為：：：如果原胞中所有的原子的位置確定的話，元胞就應(yīng)該固定下來了吧。還優(yōu)化什么啊。

優(yōu)化基矢是什么意思，改變夾角嗎？？？那樣的話也可以通過改變原子位置達到同樣的效果啊。

而且你說的這兩種應(yīng)該是優(yōu)化時同時用到了吧，不可能是只在一個優(yōu)化過程中只用一種方法吧，因為我們的結(jié)構(gòu)有可能基矢有一點問題，而離子位置的話應(yīng)該都有問題。

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5樓2010-12-07 14:01:27

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Originally posted by first_yg at 2010-12-07 09:58:08:
看來新手的問題都差不多呵，這幾天看了你的幾個帖子，都是我也曾經(jīng)或正在疑惑的問題。
不過我的ISIF最終只能用2了，因為我算的石墨烯表面，看過以前侯博士一個回帖，像這樣的低維表面不適合將Z方向體積也優(yōu)化，會 ...

你說得這句話是什么意思呢？？？
”發(fā)現(xiàn)是將整個吸附體系作為晶格常數(shù)優(yōu)化的對象，而不是單純依靠ISIF來計算。覺得這樣的方法也不錯，就是有些耗時。“

是不是把體系選得大一點，然后還是用ISIF=2呢？？？？

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6樓2010-12-07 14:06:52

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我做得是體材料，ISIF該怎么選擇呢

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7樓2010-12-07 14:07:57

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bingmou

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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
youzhizhe(金幣+1):謝謝交流。 2010-12-07 15:18:25

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Originally posted by ustbwgs at 2010-12-07 14:01:27:

ISIF大于4時，說明上說得是離子不持豫，
如果改變基矢或者優(yōu)化離子位置都會改變你原胞中原子的位置啊，
我一直認(rèn)為：：：如果原胞中所有的原子的位置確定的話，元胞就應(yīng)該固定下來了吧。還優(yōu)化什么啊。

優(yōu) ...

你沒有明白原子固定的意思。離子不弛豫，只是說他的direct坐標(biāo)不改變，也就是相對于基矢的坐標(biāo)不發(fā)生變化。而如果基矢改變了，也就是坐標(biāo)系都發(fā)生變化了，那么離子的位置就改變了。

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8樓2010-12-07 15:05:18

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youzhizhe(金幣+1):鼓勵交流。 2010-12-07 15:18:59

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Originally posted by bingmou at 2010-12-07 15:05:18:

你沒有明白原子固定的意思。離子不弛豫，只是說他的direct坐標(biāo)不改變，也就是相對于基矢的坐標(biāo)不發(fā)生變化。而如果基矢改變了，也就是坐標(biāo)系都發(fā)生變化了，那么離子的位置就改變了。

非常感謝您的解釋，對于下面的情況是你說的這樣嗎？？？
我們知道在構(gòu)造POSCAR時，可以用實際坐標(biāo)或分?jǐn)?shù)坐標(biāo)兩種方式，
由于我計算的體系比較大，300個原子左右，所以我的坐標(biāo)是實際坐標(biāo)。那這兒沒有D坐標(biāo)，怎么優(yōu)化呢？不過我發(fā)現(xiàn)每次優(yōu)化完之后出來的CONTCAR都是分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，是不是運行開始之后，VASP先把我的實坐標(biāo)轉(zhuǎn)化成分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，然后再按你說的那種方式優(yōu)化呢？？

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9樓2010-12-07 15:16:46

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bingmou

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Originally posted by ustbwgs at 2010-12-07 15:16:46:

非常感謝您的解釋，對于下面的情況是你說的這樣嗎？？？
我們知道在構(gòu)造POSCAR時，可以用實際坐標(biāo)或分?jǐn)?shù)坐標(biāo)兩種方式，
由于我計算的體系比較大，300個原子左右，所以我的坐標(biāo)是實際坐標(biāo)。那這兒沒有D坐標(biāo)，怎 ...

是的

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10樓2010-12-07 20:16:00

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sunyang1988(金幣+1):謝謝指點 2010-12-07 20:47:52

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Originally posted by ustbwgs at 2010-12-07 14:07:57:

我做得是體材料，ISIF該怎么選擇呢

一般選3就可以。

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11樓2010-12-07 20:46:09

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