 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1087 | 回復: 7 | |||
feiye2214木蟲 (正式寫手)
|
[交流]
【求助/交流】BLAST之后，怎么拿全序列啊？ 已有5人參與
|
|
從頭說起，我想獲得目的物種的beta-actin基因全序列，以一些相近物種的同源序列（mRNA完整片段）設計引物，以目的物種的基因組DNA為模板，獲得了一條853bp的序列，經(jīng)BLAST之后，與人類9號染色體上的片段相似度78%，與小鼠的：Mus musculus actin, beta, cytoplasmic (Actb), mRNA Length=1891，覆蓋率96%，相似度83%； 還有一個：PREDICTED: Mus musculus similar to gamma actin-like protein (LOC667260), misc RNA Length=1313，覆蓋率96%，相似度83%，這個“similar to gamma actin-like protein ”是說什么蛋白啊？ 與相近物種比對之后，有基因DNA序列的，也有mRNA序列的，覆蓋率、相似度都在百分之八九十！ 為什么我用的是DNA進行擴增的，序列為什么跟mRNA同源性那么高��？中間不是應該有內(nèi)含子嗎？還是850bp不夠長？都處在外顯子了？？ 進一步的問題：小弟想搞到這個beta-actin基因全序列，是不是以這個獲得的850bp的序列為設計區(qū)段，設計引物向兩頭擴增？染色體步移是不是就是說這個情況？高手給點指導哈。 [ Last edited by feiye2214 on 2010-12-25 at 14:41 ] |
回復此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實驗中的趣事：實驗器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗中的趣事：和實驗材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復
-
化學工程及工業(yè)化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有186人回復
-
蛋白質(zhì)檢測：精準分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之小鼠實驗：嚴謹設計，解析生命機制的重要載體
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之重金屬檢測：精準篩查，守護健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標南京
已經(jīng)有0人回復
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 用一對引物blast多條序列
已經(jīng)有5人回復
- 如何對已經(jīng)進行BLAST比對的序列進行功能預測
已經(jīng)有4人回復
- PSI-BLAST怎樣輸出蛋白序列的PSSM打分矩陣
已經(jīng)有13人回復
- 求助序列分析BLAST最簡潔的教程
已經(jīng)有19人回復
- 新手：請問怎么查找質(zhì)粒全基因組序列，pRR88，psp72,pcDNA3.1
已經(jīng)有8人回復
- 向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有關(guān)樣品的信息？有人遇到過么？救贖
已經(jīng)有19人回復
- 求助！PCR擴增不出全長DNA序列怎么辦？
已經(jīng)有24人回復
- blast中序列種屬問題
已經(jīng)有4人回復
- 【求助/交流】如何用NCBI的BLAST來找到一個基因的保守序列?
已經(jīng)有11人回復
- 【求助/交流】PCR產(chǎn)物序列blast怎么用？
已經(jīng)有3人回復
- 【求助/交流】用blast做primer和基因序列的檢測
已經(jīng)有3人回復
 |
2樓2010-12-25 10:30:30
rioarsenal
金蟲 (正式寫手)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 675
- 帖子: 394
- 在線: 44.7小時
- 蟲號: 1169059
- 注冊: 2010-12-13
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學
3樓2010-12-25 10:48:43
feiye2214
木蟲 (正式寫手)
- MolEPI: 1
- 應助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1824.9
- 散金: 403
- 紅花: 5
- 帖子: 564
- 在線: 209小時
- 蟲號: 883642
- 注冊: 2009-10-25
- 性別: GG
- 專業(yè): 海洋環(huán)境科學
4樓2010-12-25 10:57:40
rioarsenal
金蟲 (正式寫手)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 675
- 帖子: 394
- 在線: 44.7小時
- 蟲號: 1169059
- 注冊: 2010-12-13
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學
5樓2010-12-25 11:08:59
feiye2214
木蟲 (正式寫手)
- MolEPI: 1
- 應助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1824.9
- 散金: 403
- 紅花: 5
- 帖子: 564
- 在線: 209小時
- 蟲號: 883642
- 注冊: 2009-10-25
- 性別: GG
- 專業(yè): 海洋環(huán)境科學
6樓2010-12-25 16:17:31
haitian0625
金蟲 (小有名氣)
- 應助: 7 (幼兒園)
- 金幣: 1392.4
- 帖子: 123
- 在線: 56.9小時
- 蟲號: 903890
- 注冊: 2009-11-15
- 性別: GG
- 專業(yè): 基因表達調(diào)控與表觀遺傳學
7樓2010-12-25 16:32:34
lwzxl007
木蟲 (小有名氣)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1589.3
- 散金: 10
- 帖子: 78
- 在線: 19.8小時
- 蟲號: 859176
- 注冊: 2009-09-28
- 性別: GG
- 專業(yè): 水產(chǎn)養(yǎng)殖學
8樓2010-12-25 21:52:03
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 feiye2214 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿中國石油大學（華東） 本科齊魯工業(yè)大學 +4 | 石能偉 2026-03-17 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 070300，一志愿北航320求調(diào)劑 +3 | Jerry0216 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 289材料與化工（085600）B區(qū)求調(diào)劑 +3 | 這么名字咋樣 2026-03-22 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 306求調(diào)劑 +5 | 來好運來來來 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料學碩333求調(diào)劑 +3 | 北道巷 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +12 | 呼呼呼。。。。 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[基金申請]
學校已經(jīng)提交到NSFC，還能修改嗎？
 40+4
|
babangida 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 279求調(diào)劑 +5 | 紅衣隱官 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 白QF 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿天津大學化學工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑 +12 | yangfz 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 083200學碩321分一志愿暨南大學求調(diào)劑 +3 | innocenceF 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 初始318分求調(diào)劑（有工作經(jīng)驗） +3 | 1911236844 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 化學求調(diào)劑 +4 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿中海洋材料工程專碩330分求調(diào)劑 +8 | 小材化本科 2026-03-18 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專碩調(diào)劑 +9 | Doleres 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +9 | 想上學吖吖 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 中南大學化學學碩337求調(diào)劑 +3 | niko- 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 086500 325 求調(diào)劑 +3 | 領帶小熊 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料考研調(diào)劑 +3 | xwt。 2026-03-19 | 3/150 |
|