 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2278 | 回復(fù): 5 | |||
| 本帖產(chǎn)生 1 個 模擬EPI ，點(diǎn)擊這里進(jìn)行查看 | |||
aquariusy木蟲 (小有名氣)
|
[交流]
【求助】蛋白質(zhì)在不同pH下動力學(xué)模擬 已有3人參與
|
||
| 請問蛋白質(zhì)在不同pH下動力學(xué)模擬能做嗎？是不是和電荷有關(guān)系？最近剛開始用NAMD，還不太懂，請教大家了 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
生物學(xué)學(xué)碩，一志愿湖南大學(xué)，初試成績338
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
321求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
343求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
305求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
本科新能源科學(xué)與工程，一志愿華理能動285求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
332求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
學(xué)碩274求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
壓國家一區(qū)線，求導(dǎo)師收留，有恩必謝！
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
081200-11408-276學(xué)碩求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
22408 359分調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 【求助】重金求助：模擬一個蛋白在不同環(huán)境中的構(gòu)象
已經(jīng)有4人回復(fù)
wally8962
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 5366.7
- 紅花: 2
- 帖子: 1062
- 在線: 471.1小時
- 蟲號: 600024
- 注冊: 2008-09-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物力學(xué)
2樓2011-01-05 22:18:37
aquariusy
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 3636.3
- 紅花: 2
- 帖子: 223
- 在線: 161.4小時
- 蟲號: 838208
- 注冊: 2009-09-01
- 專業(yè): 生物化工
3樓2011-01-06 21:24:55
wally8962
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 5366.7
- 紅花: 2
- 帖子: 1062
- 在線: 471.1小時
- 蟲號: 600024
- 注冊: 2008-09-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物力學(xué)
4樓2011-01-07 10:56:01
bay__gulf
金蟲 (著名寫手)
劉蘇州
- 模擬EPI: 8
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 貴賓: 4.85
- 金幣: 2332.8
- 紅花: 1
- 帖子: 1344
- 在線: 271小時
- 蟲號: 592012
- 注冊: 2008-09-03
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
- 管轄: 分子模擬
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+5, 模擬EPI+1):謝謝 2011-01-08 14:41:00
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+5, 模擬EPI+1):謝謝 2011-01-08 14:41:00
|
經(jīng)典MD不能處理pH值的理由 http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=18011&page=1#pid90885 1 先搞清楚蛋白側(cè)鏈和封端結(jié)構(gòu)的pKa值, 比如這里的總結(jié) http://hi.baidu.com/bay__gulf618 ... 86d27728b65d4.html# 2 通過基團(tuán)的pKa 和環(huán)境的pH, 確定基團(tuán)的質(zhì)子化狀態(tài) 一般的分析化學(xué)手冊上都有公式 在線預(yù)測可以使用PROPKA 或H++ http://www.mdbbs.org/thread-6738-1-9.html 3 力場中默認(rèn)的質(zhì)子化狀態(tài)都是中性pH 下的, 如果要改變, 可以使用patch http://www.mdbbs.org/thread-10227-1-4.html |
5樓2011-01-07 11:40:36
aquariusy
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 3636.3
- 紅花: 2
- 帖子: 223
- 在線: 161.4小時
- 蟲號: 838208
- 注冊: 2009-09-01
- 專業(yè): 生物化工
6樓2011-01-07 20:19:17
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 aquariusy 的主題更新
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 347求調(diào)劑 +3 | 山頂見α 2026-03-25 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0856，材料與化工321分求調(diào)劑 +12 | 大饞小子 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 081200-314 +3 | LILIQQ 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085404求調(diào)劑，總分309，本科經(jīng)歷較為豐富 +4 | 來財aa 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)308分求調(diào)劑 +8 | 你好明天你好 2026-03-23 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +10 | 呼呼？~+123456 2026-03-24 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +9 | 小蠟新筆 2026-03-26 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 324求調(diào)劑 +5 | hanamiko 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085601求調(diào)劑總分293英一數(shù)二 +4 | 鋼鐵大炮 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境專碩324分求調(diào)劑推薦 +5 | 軒小寧—— 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿上海交大生物與醫(yī)藥專碩324分，求調(diào)劑 +6 | jiajunX 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +6 | 來好運(yùn)來來來 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 26考研-291分-廈門大學(xué)（085601）-柔性電子學(xué)院材料工程專業(yè)求調(diào)劑 +3 | min3 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[有機(jī)交流]
 有機(jī)合成求助
 20+3
|
FENGSHUJEI 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 化工專碩求調(diào)劑 +3 | question挽風(fēng) 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 300求調(diào)劑，材料科學(xué)英一數(shù)二 +5 | leaflight 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[論文投稿] 急發(fā)核心期刊論文 +3 | 賢達(dá)問津 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315分，誠求調(diào)劑，材料與化工085600 +3 | 13756423260 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑院校信息 +6 | CX 330 2026-03-21 | 6/300 |
|