 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2279 | 回復(fù): 5 | |||
| 本帖產(chǎn)生 1 個(gè) 模擬EPI ，點(diǎn)擊這里進(jìn)行查看 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
aquariusy木蟲 (小有名氣)
|
[交流]
【求助】蛋白質(zhì)在不同pH下動(dòng)力學(xué)模擬 已有3人參與
|
||
| 請(qǐng)問蛋白質(zhì)在不同pH下動(dòng)力學(xué)模擬能做嗎？是不是和電荷有關(guān)系？最近剛開始用NAMD，還不太懂，請(qǐng)教大家了 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
0703化學(xué)調(diào)劑，求導(dǎo)師收
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
各位老師好，我的一志愿為北京科技大學(xué)085601材料專碩
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿太原理工安全工程300分，求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
0856求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
11408軟件工程求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿211 初試270分 求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
300求調(diào)劑，材料科學(xué)英一數(shù)二
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
學(xué)碩274求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
本科雙非材料，跨考一志愿華電085801電氣，283求調(diào)劑，任何專業(yè)都可以
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 【求助】重金求助：模擬一個(gè)蛋白在不同環(huán)境中的構(gòu)象
已經(jīng)有4人回復(fù)
aquariusy
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 3636.3
- 紅花: 2
- 帖子: 223
- 在線: 161.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 838208
- 注冊(cè): 2009-09-01
- 專業(yè): 生物化工
3樓2011-01-06 21:24:55
wally8962
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 5366.7
- 紅花: 2
- 帖子: 1062
- 在線: 471.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 600024
- 注冊(cè): 2008-09-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物力學(xué)
2樓2011-01-05 22:18:37
wally8962
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 5366.7
- 紅花: 2
- 帖子: 1062
- 在線: 471.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 600024
- 注冊(cè): 2008-09-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物力學(xué)
4樓2011-01-07 10:56:01
bay__gulf
金蟲 (著名寫手)
劉蘇州
- 模擬EPI: 8
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 貴賓: 4.85
- 金幣: 2332.8
- 紅花: 1
- 帖子: 1344
- 在線: 271小時(shí)
- 蟲號(hào): 592012
- 注冊(cè): 2008-09-03
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
- 管轄: 分子模擬
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+5, 模擬EPI+1):謝謝 2011-01-08 14:41:00
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+5, 模擬EPI+1):謝謝 2011-01-08 14:41:00
|
經(jīng)典MD不能處理pH值的理由 http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=18011&page=1#pid90885 1 先搞清楚蛋白側(cè)鏈和封端結(jié)構(gòu)的pKa值, 比如這里的總結(jié) http://hi.baidu.com/bay__gulf618 ... 86d27728b65d4.html# 2 通過基團(tuán)的pKa 和環(huán)境的pH, 確定基團(tuán)的質(zhì)子化狀態(tài) 一般的分析化學(xué)手冊(cè)上都有公式 在線預(yù)測(cè)可以使用PROPKA 或H++ http://www.mdbbs.org/thread-6738-1-9.html 3 力場(chǎng)中默認(rèn)的質(zhì)子化狀態(tài)都是中性pH 下的, 如果要改變, 可以使用patch http://www.mdbbs.org/thread-10227-1-4.html |
5樓2011-01-07 11:40:36
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 295材料工程專碩求調(diào)劑 +7 | 1428151015 2026-03-27 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +3 | A child 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
[考研] 085602 化工專碩 338分 求調(diào)劑 +12 | 路癡小琪 2026-03-27 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 347求調(diào)劑 +3 | 山頂見α 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué) +10 | 妮妮ninicgb 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 331環(huán)境科學(xué)與工程求調(diào)劑 +3 | 熠然好運(yùn)氣 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +10 | jjjjjjjjjjl 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑11408 +3 | 劉小鹿lu 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)調(diào)劑 +4 | 愛吃番茄的旭 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿211，335分，0856，求調(diào)劑院校和導(dǎo)師 +4 | 傾____蕭 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +3 | 李嘉圖·S·路 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學(xué)碩求調(diào)劑 +4 | 崔wj 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 304材料求調(diào)劑
+4
|
鐘llll 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +3 | Amber00 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085600 材料與化工 329分求調(diào)劑 +9 | Mr. Z 2026-03-25 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿中南大學(xué)化學(xué)學(xué)碩0703總分337求調(diào)劑 +7 | niko- 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 290分調(diào)劑求助 +3 | 吉祥止止陳 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 26考研-291分-廈門大學(xué)（085601）-柔性電子學(xué)院材料工程專業(yè)求調(diào)劑 +3 | min3 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境學(xué)碩288求調(diào)劑 +8 | 皮皮皮123456 2026-03-22 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +4 | LHHL66 2026-03-23 | 4/200 |
|