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[交流]
【求助】關(guān)于CASTEP吸附模擬求助
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如圖所示 我想模擬個分子吸附到晶面表面的模型，以前一直用的是discover模塊，最近看了一些文獻，上面用到了castep模塊算吸附，所以打算用這個模塊來模擬我研究的體系吸附。 吸附的方法：首先分別對分子和晶面進行優(yōu)化，得到其能量Emole和Eslab 然后將優(yōu)化后的分子放到也已經(jīng)優(yōu)化的晶面的表面，然后再進行優(yōu)化，得到能量Etot Eads = Etot - Emole - Eslab 問題：1. 優(yōu)化時用幾何優(yōu)化這個任務(wù)嗎？ 2. 能量是幾何優(yōu)化后的out文件中的能量嗎？還是接著優(yōu)化過的構(gòu)型算能量任務(wù)？ 3. 我用FIND在out文件找能量，發(fā)現(xiàn)有很多而且很多都是重復(fù)的能量，那么哪一個是我要的呢？有沒有標識呀？ 4. 我用dmol3可以算分子的幾何優(yōu)化，可是castep就不可以了，怎么才可以優(yōu)化這個分子呀？我想不可能給分子加一個晶胞吧... 先提這么多問題吧，希望有人能夠耐心解決下哈，非常感謝... |
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5樓2011-01-07 20:42:49
2樓2011-01-07 19:20:37
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cg陳(金幣+10):恩 謝謝 2011-01-07 20:19:45
gzqdyouxia(金幣+2):謝謝提示 2011-01-07 20:25:40
cg陳(金幣+10):恩 謝謝 2011-01-07 20:19:45
gzqdyouxia(金幣+2):謝謝提示 2011-01-07 20:25:40
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1. 是用幾何優(yōu)化。 2. 就在幾何優(yōu)化的out文件中找能量。 3. Press CTRL + F and search for Final Enthalpy. Note down the value that appears in that line. 4. 確實要加一個周期性格子才能算小分子。 具體可參見軟件自帶的Tutorials Adsorption of CO onto a Pd(110) Surface |
3樓2011-01-07 19:46:01
4樓2011-01-07 20:29:46
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