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ZJboy木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[交流]
【討論】奇怪的分子軌道圖 已有9人參與
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各位有沒(méi)有試過(guò)用GV讀取formchk文件作分子軌道圖時(shí)，有時(shí)得到一些很奇怪的圖的現(xiàn)象？如果有的話，不妨討論一下。還是說(shuō)，各位總是能得到合理的分子軌道圖？ [ Last edited by zhou2009 on 2011-1-15 at 09:10 ] |
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zhou2009
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2樓2011-01-15 09:14:22
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3樓2011-01-24 19:57:49
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5樓2011-01-25 18:39:01
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7樓2011-01-25 22:13:50
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yjcmwgk(金幣+10): 2011-01-30 10:54:39
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yjcmwgk(金幣+10): 2011-01-30 10:54:39
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GV總是一是一、二是二忠實(shí)于于你提供的計(jì)算結(jié)果數(shù)據(jù)的。 GV有時(shí)得到一些很奇怪的圖的現(xiàn)象，所謂很奇怪的圖無(wú)非是出乎自己意料。 它表明了兩種可能： 一種可能是在什么地方有失誤，包含GV運(yùn)用上的失誤。有時(shí)我作密度差時(shí)，得到的結(jié)果完全出乎意料，經(jīng)過(guò)仔細(xì)查找，總能找到失誤所在，改過(guò)來(lái)就好了。 另一種可能是，這種圖形出乎意料，提供了意料之外的信息，我們必須重新認(rèn)識(shí)它、解析它，是新知的起點(diǎn)，從而有所發(fā)現(xiàn)、有所前進(jìn)。 |
8樓2011-01-26 10:08:04
ZJboy
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當(dāng)然，上面只是從MO或者ρ說(shuō)的，你計(jì)算出什么cube，GV就給你忠實(shí)地畫(huà)出來(lái)。 但是對(duì)于用球-鍵來(lái)表示分子的成鍵鍵型時(shí)，GV只從原子距離來(lái)判斷，對(duì)于恰好處在某種鍵長(zhǎng)范疇邊緣時(shí)，對(duì)鍵的有無(wú)可能出現(xiàn)失誤。 特別是由于沒(méi)有考慮電子數(shù)目，可能對(duì)芳環(huán)判斷、表達(dá)失誤。 如對(duì)于卟吩，其中相對(duì)的兩個(gè)吡咯環(huán)N上帶H，有6個(gè)電子共軛是芳環(huán)。另外相對(duì)的兩個(gè)吡咯環(huán)N上不帶H，只有5個(gè)電子共軛不是芳環(huán)。當(dāng)指定用球-鍵型（Ball & Bond Type）來(lái)表示時(shí)，GV會(huì)根據(jù)原子距離來(lái)判斷，畫(huà)出卟吩中4個(gè)吡咯環(huán)是等同的芳環(huán)。要特別小心，作圖時(shí)需要手動(dòng)操作改正過(guò)來(lái)。 |
10樓2011-01-27 09:20:07
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