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yangbob

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[交流] 【求助】用monte carlo法做分子模擬，用什么編程語言實現(xiàn)比較好？

用monte carlo法做分子模擬，用什么編程語言實現(xiàn)比較好？需要做出分子運動軌跡的圖形（團簇結構），還有RDF曲線。
本人是初學者。請各位高手說得詳細些，謝謝！

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1樓 2011-01-15 16:43:30

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ghcacj

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★
zh1987hs(金幣+1): 謝謝 2011-01-16 20:56:05

MC算法能實現(xiàn)分子運動軌跡？RDF曲線？你說的應該是MD方法吧

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2樓2011-01-15 17:08:54

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yangbob

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引用回帖:

Originally posted by ghcacj at 2011-01-15 17:08:54:
MC算法能實現(xiàn)分子運動軌跡？RDF曲線？你說的應該是MD方法吧

MC不能實現(xiàn)分子運動軌跡么？
MC肯定能反映分子結構，

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3樓2011-01-15 18:19:24

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zyj8119

木蟲 (著名寫手)

★ ★
yangbob(金幣+1): 2011-01-15 22:39:37
zh1987hs(金幣+2): 謝謝 2011-01-16 20:55:57
yangbob(金幣+1): 謝謝回復 2011-01-18 09:27:20

引用回帖:

Originally posted by yangbob at 2011-01-15 16:43:30:
用monte carlo法做分子模擬，用什么編程語言實現(xiàn)比較好？需要做出分子運動軌跡的圖形（團簇結構），還有RDF曲線。
本人是初學者。請各位高手說得詳細些，謝謝！

這要看你做的是什么monte carlo了，不過科學計算語言最好的還是FORTRAN.

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4樓2011-01-15 18:53:19

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yangbob

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引用回帖:

Originally posted by zyj8119 at 2011-01-15 18:53:19:

這要看你做的是什么monte carlo了，不過科學計算語言最好的還是FORTRAN.

用matlab和fortran 比，優(yōu)點和缺點能說一點么？

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5樓2011-01-15 22:39:30

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0610240

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zh1987hs(金幣+1): 謝謝 2011-01-17 21:57:58
zh1987hs(金幣+1): 謝謝 2011-01-17 21:58:06
yangbob(金幣+1): 謝謝回復 2011-01-18 09:27:05
yangbob(金幣+1): 2011-01-19 22:31:19

引用回帖:

Originally posted by yangbob at 2011-01-15 22:39:30:

用matlab和fortran 比，優(yōu)點和缺點能說一點么？

據(jù)說matlab 比 Fortran速度更快

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6樓2011-01-17 12:25:56

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xianggui7895

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zh1987hs(金幣+1): 謝謝 2011-01-17 21:58:03
yangbob(金幣+1): 謝謝回復 2011-01-18 09:26:53

matlab吧，容易上手。不過高手都用Fortran

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7樓2011-01-17 19:20:38

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yahoohoo

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★ ★
yangbob(金幣+1): 謝謝回復，希望繼續(xù)交流！ 2011-01-18 09:26:42
ghcacj(金幣+2): 謝謝 2011-01-19 16:39:04

我從fortran轉到c++了。c++的速度可能稍慢于fortran，但語法靈活，對程序的改動與管理更為方便

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8樓2011-01-18 01:42:56

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yangbob(金幣+1): 2011-06-10 08:29:32

請問MATLAB可以實現(xiàn)分子動力學模擬嗎？

引用回帖:

Originally posted by xianggui7895 at 2011-01-17 19:20:38:
matlab吧，容易上手。不過高手都用Fortran

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9樓2011-01-18 18:32:09

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xianggui7895

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★
ghcacj(金幣+1): 謝謝 2011-01-19 16:39:16

引用回帖:

Originally posted by 0610240 at 2011-01-18 18:32:09:
請問MATLAB可以實現(xiàn)分子動力學模擬嗎？

why not? 而且會很方便

PS：我沒編過，但是知道可以：）

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10樓2011-01-19 10:54:59

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qphll

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ghcacj(金幣+2): 謝謝 2011-01-23 15:43:11

好久沒來了, 灌水一下.

你會啥語言, 就用什么語言.

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11樓2011-01-20 12:04:15

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0610240

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啥語言都不會的飄過

引用回帖:

Originally posted by qphll at 2011-01-20 12:04:15:
好久沒來了, 灌水一下.

你會啥語言, 就用什么語言.

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12樓2011-01-21 12:43:30

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wl1777

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ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-02-05 20:52:54
yangbob(金幣+1): 2011-06-10 08:29:54

只會Fortran的含淚飄過。MC算RDF應該沒問題，也就是一個數(shù)個數(shù)的問題。

軌跡這個問題就比較復雜，不是很好解決，就算出來的結果可能和實際系統(tǒng)查得也挺大。

MC原則上說畢竟只是一個擲骰子的游戲。

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13樓2011-01-24 06:35:46

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wuchenwf

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ghcacj(金幣+1): 謝謝 2011-02-05 20:53:01
yangbob(金幣+1): 2011-06-10 08:30:03

速度最快的肯定還是F啊，

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14樓2011-01-26 17:14:07

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wangqingbo

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ghcacj(金幣+2): 謝謝 2011-02-05 20:53:07

推薦C＋＋，其實語言之爭由來已久，不多綜合考慮還是認為C＋＋好

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15樓2011-01-28 12:48:54

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1dubo

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ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-03-04 10:21:46
yangbob(金幣+1): 2011-06-10 08:30:10

MATLAB使用起來，方便，學起來簡單易懂，畫圖方便，但是對于計算來講，計算大體系時，速度特慢
Fortran 語言環(huán)境跟MATLAB相似，但是程序出來時感覺比較亂，一般初學者學習應慎重，不過速度相當快，一般高手喜歡
C/C++個人認為是最好的，程序有條理，適合初學者學習，速度也比較快。

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16樓2011-03-03 21:27:51

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dubo

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ghcacj(金幣+2): 謝謝 2011-03-09 14:11:27
御劍江湖(金幣+1): 謝謝 2011-06-08 16:27:08
yangbob(金幣+1): 2011-06-10 08:30:14

這個可以有，呵呵
matlab可以實現(xiàn)MC,算小體系較快，不過體系一大，速度特慢，比C和fortran慢多了
不過他的語言簡單易學。
C，fortran比較適合做計算，一是速度好，二是可以移植好

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17樓2011-03-08 11:26:32

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御劍江湖(金幣+3): 謝謝 2011-06-08 16:26:56
yangbob(金幣+1): 2011-06-10 08:30:20

python/c++
http://code.google.com/p/gce-ising/

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18樓2011-06-08 14:38:53

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李學忠

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fortran

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19樓2011-06-08 18:14:48

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yahoohoo

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御劍江湖(金幣+3): 謝謝 2011-06-09 18:28:22
yangbob(金幣+1): 2011-06-10 08:30:25

引用回帖:

Originally posted by ghcacj at 2011-01-15 17:08:54:
MC算法能實現(xiàn)分子運動軌跡？RDF曲線？你說的應該是MD方法吧

這取決于體系的動力學特征。如果是隨機的，那么MC完全可以。我以前在別的回帖中說過，例如高分子鏈在溶液中的動力學，你完全可以使用MC來研究。

至于樓主所問的編程語言，我推薦c++(幾年前用的是fortran)。速度不比fortran慢什么，但是修改及管理比fortran更為靈活。

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20樓2011-06-09 00:10:02

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yongleli

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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
御劍江湖(金幣+3): 謝謝 2011-06-09 18:28:04
yangbob(金幣+1): 2011-06-10 08:30:32

引用回帖:

Python可以。網上有現(xiàn)成的模板程序：

Dynamo

不要錢兒。請自行google獲取。

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21樓2011-06-09 12:06:08

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yangbob(金幣+1):謝謝參與
zh1987hs(金幣+3): 謝謝 2011-06-26 22:03:19

我從原來使用fortran77到現(xiàn)在的Fortran 95，我覺得Fortran在計算方面比C強，而且現(xiàn)在高級Fortran語言的模塊化功能非常強大。我現(xiàn)在寫的Fortran軟件包基本上都采用模塊格式。非常方便增減

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22樓2011-06-26 00:23:14

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★
yangbob(金幣+1): 謝謝參與

到底是用什么語言啊，對于一個初學者

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23樓2013-07-10 13:22:11

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qinjianfa

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★
yangbob(金幣+1): 謝謝參與

引用回帖:

20樓: Originally posted by yahoohoo at 2011-06-09 00:10:02
這取決于體系的動力學特征。如果是隨機的，那么MC完全可以。我以前在別的回帖中說過，例如高分子鏈在溶液中的動力學，你完全可以使用MC來研究。

至于樓主所問的編程語言，我推薦c++(幾年前用的是fortran)。速度 ...

朋友，可以交流一下MC嘛？在軟件方面，求助

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24樓2013-10-21 15:18:21

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yahoohoo

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25樓2013-10-22 01:11:05

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fucunfc

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mc不能描述分子運動軌跡吧，rdf肯定沒問題的。語言的話matlab就算了，用它會讓別人低看你的。做科研的話fortran肯定是首選，大家都用。c++的話功能更加強大，做計算機程序肯定優(yōu)于fortran，但是fortran做科研夠用了。

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26樓2013-11-13 20:55:45

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