oscar5667

新蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 8224.4
帖子: 1115
在線: 179.9小時(shí)
蟲號(hào): 309926

[交流] 【求助】abinit 內(nèi)存要2.73G,算不動(dòng)咋辦？

算個(gè)晶體的介電常數(shù)，23個(gè)原子，弄好了輸入文件和贗勢(shì)文件，

計(jì)算1秒鐘后出log說(shuō)內(nèi)存需要2783.030 Mbytes
================================================================================
P This job should need less than                   2783.030 Mbytes of memory.
  Rough estimation (10% accuracy) of disk space for files :
  WF disk file : 901.760 Mbytes ; DEN or POT disk file :    0.529 Mbytes.
STOP 1
================================================================================

Biggest array : cg(disk), with 901.7598 MBytes.
memana : allocated an array of 901.760 Mbytes, for testing purposes.

memana : ERROR -
  Test failed to allocate 2783.030 Mbytes
  It is not worth to continue
  Action : modify input variable to fit the available memory.
  or increase limit on available memory.
===========================================================================
我這體系是不是太大了，我的工作站是4個(gè)G內(nèi)存，我還以為夠了，是不是abinit分派不了這么大的內(nèi)存呢？謝謝專家指教！

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

環(huán)境領(lǐng)域全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室招收博士1-2名已經(jīng)有3人回復(fù)
材料專碩306英一數(shù)二已經(jīng)有10人回復(fù)
301求調(diào)劑已經(jīng)有6人回復(fù)
一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑已經(jīng)有7人回復(fù)
302求調(diào)劑已經(jīng)有6人回復(fù)
26博士申請(qǐng) 已經(jīng)有3人回復(fù)
268求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
311求調(diào)劑已經(jīng)有10人回復(fù)
被我言中：新模板不強(qiáng)調(diào)格式了，假專家開始管格式了已經(jīng)有4人回復(fù)
303求調(diào)劑已經(jīng)有5人回復(fù)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:

關(guān)于CASTEP 中計(jì)算時(shí)出錯(cuò) 已經(jīng)有6人回復(fù)
請(qǐng)教：orca 中用CCSD(T)計(jì)算單點(diǎn)能出錯(cuò)--提示內(nèi)存不足該怎么辦？已經(jīng)有10人回復(fù)
3D計(jì)算內(nèi)存需求已經(jīng)有7人回復(fù)
系統(tǒng)內(nèi)存識(shí)別的問(wèn)題已經(jīng)有9人回復(fù)
abinit能否處理一個(gè)位置被兩種元素占據(jù)的固溶體的能帶和態(tài)密度已經(jīng)有10人回復(fù)
【求助成功】如何處理算不動(dòng)的情況已經(jīng)有17人回復(fù)
【求助】利用abinit或pwscf軟件在單機(jī)上可以計(jì)算半導(dǎo)體材料的哪些性質(zhì)? 已經(jīng)有8人回復(fù)

» 搶金幣啦！回帖就可以得到:

查看全部散金貼

1樓 2011-01-18 17:33:44

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lbambool

木蟲 (著名寫手)

★
zzy870720z(金幣+1): 謝謝交流 2011-01-18 19:41:44
oscar5667(金幣+1): 2011-01-19 10:39:00

你4G內(nèi)存是幾核共用？提交時(shí)是只用一個(gè)核心算還是多核？四核的話一個(gè)核只有1G了。有些操作系統(tǒng)還有單進(jìn)程2G內(nèi)存的限制，你查一下你的系統(tǒng)。

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

2樓2011-01-18 19:07:14

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

frank_zhan

金蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 819.6
帖子: 577
在線: 136.4小時(shí)
蟲號(hào): 688836

★
oscar5667(金幣+1): 2011-01-19 16:23:03
zhang668(金幣+1): 多謝提示 2011-01-19 21:04:01

可否把k點(diǎn)的數(shù)量減少一些，這樣應(yīng)該是可以減少內(nèi)存的使用量。

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

3樓2011-01-19 09:42:49

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

yy08

木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 7547.9
帖子: 1525
在線: 163.8小時(shí)
蟲號(hào): 472942

★
zhang668(金幣+1): 多謝交流 2011-01-19 21:04:13

引用回帖:

Originally posted by lbambool at 2011-01-18 19:07:14:
你4G內(nèi)存是幾核共用？提交時(shí)是只用一個(gè)核心算還是多核？四核的話一個(gè)核只有1G了。有些操作系統(tǒng)還有單進(jìn)程2G內(nèi)存的限制，你查一下你的系統(tǒng)。

是這樣的，所以你只能用一個(gè)核去算。

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

4樓2011-01-19 10:15:57

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

oscar5667

新蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 8224.4
帖子: 1115
在線: 179.9小時(shí)
蟲號(hào): 309926

謝謝

引用回帖:

謝謝哦，呵呵！
我的工作站是DELL T3400 兩核。用的是centos 5.5系統(tǒng)，abinit5.7.3

提交時(shí)我也不知道是用幾個(gè)核？是在輸入文件里面設(shè)定嗎？

剛剛接觸abinit不久，不好意思！

贊一下

回復(fù)此樓

5樓2011-01-19 10:42:51

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lbambool

木蟲 (著名寫手)

兩個(gè)核，每個(gè)核只分2G了

贊一下

回復(fù)此樓

6樓2011-01-19 12:07:50

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

oscar5667

新蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 8224.4
帖子: 1115
在線: 179.9小時(shí)
蟲號(hào): 309926

引用回帖:

Originally posted by lbambool at 2011-01-19 12:07:50:
兩個(gè)核，每個(gè)核只分2G了

哦，是這樣，有沒(méi)有什么方法可以充分利用4G的內(nèi)存？呵呵
要不就算不了了，嗨！

贊一下

回復(fù)此樓

7樓2011-01-19 13:20:53

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lbambool

木蟲 (著名寫手)

★
zzy870720z(金幣+1): 謝謝交流 2011-01-19 16:08:37

我沒(méi)有用過(guò)abinit，但一般的軟件的設(shè)置里會(huì)有限制用最大的內(nèi)存，那樣軟件會(huì)想辦法在硬盤上開辟空間來(lái)交換數(shù)據(jù)，使物理內(nèi)存小于預(yù)算內(nèi)存時(shí)可以進(jìn)行計(jì)算，你看一下軟件的說(shuō)明書。

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

8樓2011-01-19 14:07:29

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

oscar5667

新蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 8224.4
帖子: 1115
在線: 179.9小時(shí)
蟲號(hào): 309926

引用回帖:

Originally posted by lbambool at 2011-01-19 14:07:29:
我沒(méi)有用過(guò)abinit，但一般的軟件的設(shè)置里會(huì)有限制用最大的內(nèi)存，那樣軟件會(huì)想辦法在硬盤上開辟空間來(lái)交換數(shù)據(jù)，使物理內(nèi)存小于預(yù)算內(nèi)存時(shí)可以進(jìn)行計(jì)算，你看一下軟件的說(shuō)明書。

ok，好的，謝謝專家解答，嘿嘿

贊一下

回復(fù)此樓

9樓2011-01-19 16:23:35

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lbambool

木蟲 (著名寫手)

慚愧啊，我不是專家

贊一下

回復(fù)此樓

10樓2011-01-19 17:11:20

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

ljludwig

新蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 39.3
帖子: 5
在線: 1.8小時(shí)
蟲號(hào): 1870718

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

暈，這個(gè)辦法有好多種。

第一種是減少energy cutoff，即ecut;
第二種是減少K-mesh.

但是這樣都不能保證收斂。所以如果保證收斂的情況下，

可以設(shè)置mkmem, mffmem等，這樣的話就不通過(guò)內(nèi)存來(lái)算，而是暫時(shí)存在disk上。
這樣會(huì)慢一些，但是會(huì)解決內(nèi)存的問(wèn)題。

設(shè)置方法在幫助說(shuō)明里都有：
http://www.abinit.org/documentat ... /varfil.html#mffmem

[ Last edited by ljludwig on 2013-2-7 at 03:26 ]

贊一下

回復(fù)此樓

11樓2013-02-07 03:25:44

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]	作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑 +7	yangfz 2026-03-17	7/350	2026-03-17 23:57 by 星空星月
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑，六級(jí)已過(guò)，有科研經(jīng)歷 +8	曦熙兮 2026-03-15	8/400	2026-03-17 20:31 by xilongliang
[考研] 材料與化工求調(diào)劑 +6	為學(xué)666 2026-03-16	6/300	2026-03-17 20:15 by peike
[考研] 304求調(diào)劑 +8	小熊joy 2026-03-14	8/400	2026-03-17 17:29 by ruiyingmiao
[考研] 化學(xué)工程321分求調(diào)劑 +11	大米飯！ 2026-03-15	14/700	2026-03-17 17:11 by ruiyingmiao
[考研] 26考研求調(diào)劑 +6	丶宏Sir 2026-03-13	6/300	2026-03-17 16:13 by 醉在風(fēng)里
[考研] 278求調(diào)劑 +3	Yy7400 2026-03-13	3/150	2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 283求調(diào)劑 +3	聽風(fēng)就是雨； 2026-03-16	3/150	2026-03-17 07:41 by 熱情沙漠
[考研] 藥學(xué)383 求調(diào)劑 +3	藥學(xué)chy 2026-03-15	4/200	2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 304求調(diào)劑 +3	曼殊2266 2026-03-14	3/150	2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 311求調(diào)劑 +5	26研0 2026-03-15	5/250	2026-03-16 16:21 by a不易
[考研] 080500，材料學(xué)碩302分求調(diào)劑學(xué)校 +4	初識(shí)可樂(lè) 2026-03-14	5/250	2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 中科大材料專碩319求調(diào)劑 +3	孟鑫材料 2026-03-13	3/150	2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 297一志愿上交085600求調(diào)劑 +5	指尖八千里 2026-03-14	5/250	2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 求材料調(diào)劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機(jī)器學(xué)習(xí) 一志愿哈工大 +4	林yaxin 2026-03-12	4/200	2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 求材料調(diào)劑 +5	隔壁陳先生 2026-03-12	5/250	2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] 0703化學(xué)一志愿211 總分320求調(diào)劑 +5	瑪卡巴卡啊哈 2026-03-11	5/250	2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 材料與化工085600調(diào)劑求老師收留 +9	jiaanl 2026-03-11	9/450	2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[碩博家園] 085600 260分求調(diào)劑 +3	天空還下雨么 2026-03-13	5/250	2026-03-13 18:46 by 天空還下雨么
[考研] 277求調(diào)劑 +4	anchor17 2026-03-12	4/200	2026-03-13 11:15 by 白夜悠長(zhǎng)