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【求助】abinit 內(nèi)存要2.73G,算不動(dòng)咋辦？
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算個(gè)晶體的介電常數(shù)，23個(gè)原子，弄好了輸入文件和贗勢文件， 計(jì)算1秒鐘后出log說內(nèi)存需要2783.030 Mbytes ================================================================================ P This job should need less than 2783.030 Mbytes of memory. Rough estimation (10% accuracy) of disk space for files : WF disk file : 901.760 Mbytes ; DEN or POT disk file : 0.529 Mbytes. STOP 1 ================================================================================ Biggest array : cg(disk), with 901.7598 MBytes. memana : allocated an array of 901.760 Mbytes, for testing purposes. memana : ERROR - Test failed to allocate 2783.030 Mbytes It is not worth to continue Action : modify input variable to fit the available memory. or increase limit on available memory. =========================================================================== 我這體系是不是太大了，我的工作站是4個(gè)G內(nèi)存，我還以為夠了，是不是abinit分派不了這么大的內(nèi)存呢？謝謝專家指教！  |
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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暈，這個(gè)辦法有好多種。 第一種是減少energy cutoff，即ecut; 第二種是減少K-mesh. 但是這樣都不能保證收斂。所以如果保證收斂的情況下， 可以設(shè)置mkmem, mffmem等，這樣的話就不通過內(nèi)存來算，而是暫時(shí)存在disk上。 這樣會(huì)慢一些，但是會(huì)解決內(nèi)存的問題。 設(shè)置方法在幫助說明里都有： http://www.abinit.org/documentat ... /varfil.html#mffmem [ Last edited by ljludwig on 2013-2-7 at 03:26 ] |
11樓2013-02-07 03:25:44
lbambool
木蟲 (著名寫手)
- 1ST強(qiáng)帖: 7
- 應(yīng)助: 35 (小學(xué)生)
- 金幣: 3755.1
- 帖子: 2403
- 在線: 393.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 96218
2樓2011-01-18 19:07:14
3樓2011-01-19 09:42:49
4樓2011-01-19 10:15:57
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