 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 627 | 回復(fù): 6 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】選取the water molecules inside the channels to maintain the structural s 已有2人參與
|
|||
|
這是pdb文件（在附件中）： 在產(chǎn)生psf文件前，我不太清楚怎樣選取通道中的水分子，我自己選了一下，大家看一下我選的對不對，期待大家的指點，先謝謝了： 之前我是利用替換矩陣的方法構(gòu)建了一個四聚體為1YMG-all.pdb mol load pdb 1YMG-all.pdb foreach S { A B C D } { set seg [atomselect top "segname $S and chain A"] $seg writepdb seg$S.pdb $seg delete } foreach S { A B C D } { set wat [atomselect top "segname $S and resname HOH and resid 524 579 417 433 447 448 453 462 469 470 477 480 490 491 492 493 501 507 513 515 518 519 520 522 523 529 531 532 539 542 544 546 551 553 558 559 562 563 564 566 567 569 572 573 576 578 581"] $wat writepdb crystwat$S.pdb $wat delete } 或者： mol load pdb 1YMG-all.pdb foreach S { A B C D } { set seg [atomselect top "segname $S and chain A"] $seg writepdb seg$S.pdb $seg delete } foreach S { A B C D } { set wat [atomselect top "segname $S and resname HOH and within 12.14 of chain A"] $wat writepdb crystwat$S.pdb $wat delete } |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
288資源與環(huán)境專碩求調(diào)劑，不限專業(yè)，有學(xué)上就行
已經(jīng)有20人回復(fù)
-
311（085601）求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
材料調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
一志愿 南京航空航天大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
0856材料與化工調(diào)劑，339
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
08工科275分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
334分 一志愿武理-080500 材料求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
324分 085600材料與化工
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
各位老師好，我的一志愿為北京科技大學(xué)085601材料專碩
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
309求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
4樓2011-02-16 11:48:34
qphll
金蟲 (正式寫手)
- 模擬EPI: 10
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 金幣: 2708.7
- 散金: 2294
- 紅花: 8
- 帖子: 554
- 在線: 227.1小時
- 蟲號: 89654
- 注冊: 2005-08-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 碳素材料與超硬材料
2樓2011-02-16 09:23:00
3樓2011-02-16 09:32:57
5樓2011-02-16 12:35:13
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 化學(xué)308分調(diào)劑 +11 | 你好明天你好 2026-03-30 | 12/600 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +7 | 李芷新1 2026-03-31 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 本2一志愿C9-333分，材料科學(xué)與工程，求調(diào)劑 +9 | 升升不降 2026-03-31 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)354求調(diào)劑 +15 | 101次希望 2026-03-28 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 346求調(diào)劑 一志愿070303有機化學(xué) +11 | 蘿卜燉青菜 2026-03-28 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 080500-315分復(fù)試調(diào)劑 +9 | 上岸3821 2026-03-31 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +9 | 藍月亮亮 2026-03-30 | 9/450 |
|
|
|
[考博] 材料專業(yè)申博 +5 | 杜雨婷dyt 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +17 | land xuxu 2026-03-26 | 17/850 |
|
|
|
[考研] 313求調(diào)劑 +6 | 賣個關(guān)子吧 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 南京大學(xué)化學(xué)調(diào)劑 +11 | 景隨風(fēng) 2026-03-29 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范化學(xué)332分求調(diào)劑 +3 | Lyy930824@ 2026-03-29 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +8 | 星野? 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑（080500） +14 | A child 2026-03-27 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 085404求調(diào)劑，總分309，本科經(jīng)歷較為豐富 +6 | 來財aa 2026-03-25 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +15 | Micky11223 2026-03-25 | 20/1000 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +5 | 1428151015 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0856調(diào)劑 +5 | 求求讓我有書讀?/a> 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 復(fù)試調(diào)劑，一志愿南農(nóng)083200食品科學(xué)與工程 +5 | XQTJZ 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學(xué)碩求調(diào)劑 +3 | 崔wj 2026-03-26 | 3/150 |
|