 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1101 | 回復: 8 | |||
[交流]
【求助】Alignment of Membrane and Protein選擇中心的問題(已解決) 已有3人參與
|
|
四聚體蛋白加了水盒子，也去刪掉了badwater，POPE也建好了。下面： 第一步：Alignment of Membrane and Protein 我這個蛋白(1YMG)結晶體是單體，通過Substitution Matrix構建成的四聚體，現(xiàn)在這一步有個問題： 通過查詢文獻只知道了單體的中心（NPA），而四聚體的中心查不到，在膜教程第24頁發(fā)現(xiàn)： ①set vest [atomselect $kcsamol "protein and resid 97 to 106"] 在這個命令中，我是否可以直接寫“protein”？？ ②還有就是為什么在這里$kcsa move [transxis z -25]非要旋轉25°嗎？？ ③是否蛋白在鑲嵌到膜中時有一定的規(guī)則，比如必須是卡在某幾個疏水氨基酸上？？ 第二步：Combination of Membrane and Protein ④和第一步銜接時，這一步有沒有需要提醒的。 [ Last edited by nufang19a on 2011-3-3 at 19:32 ] |
回復此樓» 猜你喜歡
0817 化學工程 299分求調劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章
已經(jīng)有4人回復
-
0854可跨調劑，一作一項核心論文五項專利，省、國級證書40+數(shù)一英一287
已經(jīng)有5人回復
-
070300化學319求調劑
已經(jīng)有6人回復
-
一志愿985，本科211，0817化學工程與技術319求調劑
已經(jīng)有6人回復
-
一志愿西南交大，求調劑
已經(jīng)有3人回復
-
286求調劑
已經(jīng)有6人回復
-
焦慮
已經(jīng)有11人回復
-
331求調劑（0703有機化學
已經(jīng)有7人回復
-
298-一志愿中國農(nóng)業(yè)大學-求調劑
已經(jīng)有5人回復
-
297求調劑
已經(jīng)有5人回復
» 本主題相關價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 【求助】關于楊偉濤的Density-Functional Theory of Atoms and Molecules
已經(jīng)有13人回復
- 請教關于α，β-不飽和酮的選擇性酮還原問題
已經(jīng)有5人回復
- 急求埃索美拉唑鈉溶解度的問題
已經(jīng)有11人回復
- Journal of applied Polymer science 審稿人
已經(jīng)有7人回復
- 請問university of florida的associate professor是終身職位嗎？這種人push嗎？
已經(jīng)有15人回復
- 超級郁悶的Journal Of Membrane Science投稿經(jīng)歷
已經(jīng)有12人回復
- 有關希夫堿提純的問題
已經(jīng)有3人回復
- Theory and Practice of Metal Electrodeposition
已經(jīng)有55人回復
- 關于選調生問題求指教
已經(jīng)有6人回復
- 做消費行為研究，兩個問題得分相乘得出來的分數(shù)是不是連續(xù)變量？
已經(jīng)有4人回復
- 【求助】鋁片為基底進行聚合物涂覆出現(xiàn)的相親性問題
已經(jīng)有7人回復
- Chem3D中優(yōu)化的問題
已經(jīng)有6人回復
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology投稿周期問題
已經(jīng)有10人回復
- Membrane Technology Lab Department of Chemical and Biochemical Engineering, XMU
已經(jīng)有3人回復
- 跪求關于二氧化硅小球分散性問題！
已經(jīng)有4人回復
|
通過搜索發(fā)現(xiàn)了bay_golf618的兩個與膜蛋白的帖子 http://www.mdbbs.org/viewthread. ... mp;highlight=%C4%A4 這個還有腳本 http://www.mdbbs.org/thread-20604-1-1.html 現(xiàn)在都不知道，到底是跟著bay_golf618寫的走還是跟著教程走，因為他寫的都很有說服力，我這菜鳥，暈啊。 其實第一步：Alignment of Membrane and Protein第二步：Combination of Membrane and Protein完全可以參照bay_golf618的http://www.mdbbs.org/viewthread. ... mp;highlight=%C4%A4 這個帖子做完 [ Last edited by nufang19a on 2011-3-2 at 11:57 ] |
2樓2011-03-02 11:41:24
3樓2011-03-02 12:01:23
4樓2011-03-02 16:52:43
weishenme
金蟲 (小有名氣)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 981.3
- 帖子: 128
- 在線: 52.6小時
- 蟲號: 45892
- 注冊: 2004-05-15
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物大分子結構與功能
★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
|
這篇文獻或許對你有點幫助，雖然其中的方法你用不上。 Setting up and running molecular dynamics simulations of membrane proteins http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2006.08.006 |
5樓2011-03-03 09:00:25
6樓2011-03-03 09:11:25
7樓2011-03-03 12:03:32
123690797
銀蟲 (初入文壇)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 807.5
- 散金: 1
- 帖子: 19
- 在線: 18.3小時
- 蟲號: 1242146
- 注冊: 2011-03-23
- 專業(yè): 熱力學
8樓2011-10-13 16:52:59
123690797
銀蟲 (初入文壇)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 807.5
- 散金: 1
- 帖子: 19
- 在線: 18.3小時
- 蟲號: 1242146
- 注冊: 2011-03-23
- 專業(yè): 熱力學
9樓2011-10-13 17:00:54
相關版塊跳轉
我要訂閱樓主 nufang19a 的主題更新
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0817 化學工程 299分求調劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章 +4 | rare12345 2026-03-18 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[教師之家] 焦慮 +8 | 水冰月月野兔 2026-03-13 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 331求調劑（0703有機化學 +6 | ZY-05 2026-03-13 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 266求調劑 +4 | 陽陽哇塞 2026-03-14 | 8/400 |
|
|
|
[基金申請] 被我言中：新模板不強調格式了，假專家開始管格式了 +4 | beefly 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085601專碩，總分342求調劑，地區(qū)不限 +4 | share_joy 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 有沒有道鐵/土木的想調劑南林，給自己招師弟中～ +3 | TqlXswl 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[論文投稿] 有沒有大佬發(fā)小論文能帶我個二作 +3 | 增銳漏人 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 11408 一志愿西電，277分求調劑
+3
|
zhouzhen654 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 機械專碩325，尋找調劑院校 +3 | y9999 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 化學調劑0703 +8 | 啊我我的 2026-03-11 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 326求調劑 +4 | 諾貝爾化學獎覬?/a> 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 070300化學學碩求調劑 +6 | 太想進步了0608 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 070303 總分349求調劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 070305求調劑 +3 | mlpqaz03 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 304求調劑 +6 | Mochaaaa 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求材料調劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機器學習 一志愿哈工大 +4 | 林yaxin 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703化學一志愿211 總分320求調劑 +5 | 瑪卡巴卡啊哈 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料301分求調劑 +5 | Liyouyumairs 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 270求調劑 085600材料與化工專碩 +3 | YXCT 2026-03-11 | 3/150 |
|