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【求助】請大家?guī)兔纯催@篇文獻的環(huán)氧樹脂的模型是怎么建的？
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我根據(jù)附件中（http://good.gd/1031395.htm或者直接從學術(shù)期刊網(wǎng)上下題目：環(huán)氧樹脂的分子模擬研究）的文獻來建交聯(lián)的環(huán)氧樹脂模型，先把文獻29頁的步驟貼下面啊，方便大家討論。 步驟一:基于一個原子一個原子的方式建立DGEBA和IPD的小分子單體的二維活性結(jié)構(gòu)模型。分別對這兩個模型進行能量優(yōu)化以獲得合理的三維結(jié)構(gòu)。并用QEq方法[31]分配原子的局部電荷。移除末端官能基團上的活性氫，剩下含有碳或氮反應(yīng)位點的分子片段（下稱作反應(yīng)性分子片段）用于下一步�！霸嫉摹薄ⅰ盎钚缘摹� 和“反應(yīng)性”官能基團的模型化如圖2.7所示。 步驟二:將16個“反應(yīng)性”的DGEBA分子片段和8個反應(yīng)性的IPD分子片段放入預(yù)先定義好的三維盒子內(nèi)（選定的盒子尺寸對應(yīng)的密度值為1.131 g/cm3）。所用 的方法是Theodorou和Suter[2]提出的“隨機自避行走”方法，這個算法在Cerius2分子模擬軟件的Amorphous Builder模塊中執(zhí)行。為了排除邊界效應(yīng)和使得模型更 “實際”，在立方元胞盒子上強加了周期邊界條件。產(chǎn)生的模型系統(tǒng)用來代表樹脂 組分和固化劑組分在化學計量比1:1（官能團的數(shù)目比）下初始的物理熔融混物。 本來想把圖片也貼上來的，但是不知道怎么弄？復制粘貼不好使。 步驟一中的原子模型我都建完了，其中移除末端官能團上的活性氫，我的理解是指把氫刪掉，但是我刪完了之后用amorphous cell 建步驟二的三維盒子時，失敗，提示原因是：力場不對。文獻中作者用的力場是dreiding,版本是MS4.0；我用的是版本MS4.3，力場compass.（我使用的軟件amorphous cell 模塊沒有dreiding這個力場） 不知道是我對文獻的理解不對還是哪操作錯誤了，請各位牛人幫忙指導一下，謝謝。 [ Last edited by zhangyu08 on 2011-3-8 at 16:48 ] |
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2樓2011-03-08 20:21:55
3樓2011-03-09 15:46:18
★
zhangyu08(金幣+1):謝謝參與
zhangyu08(金幣+1): 2011-04-11 13:54:11
zhangyu08(金幣+1): 2011-04-11 13:54:24
zhangyu08(金幣+1):謝謝參與
zhangyu08(金幣+1): 2011-04-11 13:54:11
zhangyu08(金幣+1): 2011-04-11 13:54:24
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5樓2011-04-09 19:44:17
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簡單回復
xbx04074樓
2011-03-09 15:51
回復
zhangyu08(金幣+1):謝謝參與
zhangyu08(金幣+1): 2011-03-09 15:58:33
zhangyu08(金幣+1): 2011-04-11 13:54:35
zhangyu08(金幣+1): 2011-03-09 15:58:33
zhangyu08(金幣+1): 2011-04-11 13:54:35
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