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【求助】請(qǐng)大家?guī)兔纯催@篇文獻(xiàn)的環(huán)氧樹(shù)脂的模型是怎么建的？
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我根據(jù)附件中（http://good.gd/1031395.htm或者直接從學(xué)術(shù)期刊網(wǎng)上下題目：環(huán)氧樹(shù)脂的分子模擬研究）的文獻(xiàn)來(lái)建交聯(lián)的環(huán)氧樹(shù)脂模型，先把文獻(xiàn)29頁(yè)的步驟貼下面啊，方便大家討論。 步驟一:基于一個(gè)原子一個(gè)原子的方式建立DGEBA和IPD的小分子單體的二維活性結(jié)構(gòu)模型。分別對(duì)這兩個(gè)模型進(jìn)行能量?jī)?yōu)化以獲得合理的三維結(jié)構(gòu)。并用QEq方法[31]分配原子的局部電荷。移除末端官能基團(tuán)上的活性氫，剩下含有碳或氮反應(yīng)位點(diǎn)的分子片段（下稱作反應(yīng)性分子片段）用于下一步�！霸嫉摹�、“活性的” 和“反應(yīng)性”官能基團(tuán)的模型化如圖2.7所示。 步驟二:將16個(gè)“反應(yīng)性”的DGEBA分子片段和8個(gè)反應(yīng)性的IPD分子片段放入預(yù)先定義好的三維盒子內(nèi)（選定的盒子尺寸對(duì)應(yīng)的密度值為1.131 g/cm3）。所用 的方法是Theodorou和Suter[2]提出的“隨機(jī)自避行走”方法，這個(gè)算法在Cerius2分子模擬軟件的Amorphous Builder模塊中執(zhí)行。為了排除邊界效應(yīng)和使得模型更 “實(shí)際”，在立方元胞盒子上強(qiáng)加了周期邊界條件。產(chǎn)生的模型系統(tǒng)用來(lái)代表樹(shù)脂 組分和固化劑組分在化學(xué)計(jì)量比1:1（官能團(tuán)的數(shù)目比）下初始的物理熔融混物。 本來(lái)想把圖片也貼上來(lái)的，但是不知道怎么弄？復(fù)制粘貼不好使。 步驟一中的原子模型我都建完了，其中移除末端官能團(tuán)上的活性氫，我的理解是指把氫刪掉，但是我刪完了之后用amorphous cell 建步驟二的三維盒子時(shí)，失敗，提示原因是：力場(chǎng)不對(duì)。文獻(xiàn)中作者用的力場(chǎng)是dreiding,版本是MS4.0；我用的是版本MS4.3，力場(chǎng)compass.（我使用的軟件amorphous cell 模塊沒(méi)有dreiding這個(gè)力場(chǎng)） 不知道是我對(duì)文獻(xiàn)的理解不對(duì)還是哪操作錯(cuò)誤了，請(qǐng)各位牛人幫忙指導(dǎo)一下，謝謝。 [ Last edited by zhangyu08 on 2011-3-8 at 16:48 ] |
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