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【求助/交流】質(zhì)粒的不相容性
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資料: 中文名稱:質(zhì)粒不相容性 英文名稱:plasmid incompatibility 定義1:細菌質(zhì)粒分類的一種標準,指在無選擇壓力的條件下,親緣關系密切的不同質(zhì);蛲徊幌嗳萑旱馁|(zhì)粒不能穩(wěn)定共存于同一宿主細胞,在細胞增殖過程中將有一種被排斥的現(xiàn)象。 所屬學科:生物化學與分子生物學(一級學科);核酸與基因(二級學科) 定義2:同一類型質(zhì)粒不能在同一細胞中并存的現(xiàn)象。 同種的或親緣關系相近的兩種質(zhì)粒不能同時穩(wěn)定地保持在一個細胞內(nèi)的現(xiàn)象,稱為質(zhì)粒不相容性。當一種新的質(zhì)粒進入已經(jīng)含有質(zhì)粒的細胞中時,若兩種質(zhì)粒同源或近緣,它們就會競爭資源,而競爭的結果就是一個勝利另一個則被消除。但此過程需要幾代或幾十代或更長的細菌繁殖周期,而并不是一個快速的過程。質(zhì)粒被分為兩大組,同組中的質(zhì)粒會相互競爭排斥。 如果使帶有同種的或親緣關系相近質(zhì)粒的細菌彼此雜交,質(zhì)粒DNA的傳遞可受抑制,但這種稱為表面排斥(surface exclusion),以便與不相容性相區(qū)別。不相容現(xiàn)象的機制尚未詳細闡明,可能是在質(zhì)粒DNA復制的某個階段起相互排斥的作用。這種現(xiàn)象是質(zhì)粒分類的主要指標。此外,整合到寄主染色體中的質(zhì)粒和自主性質(zhì)粒之間也具有不相容性,例如在大腸桿菌的Hfr菌株細胞中,自主性質(zhì)粒F因子就不能穩(wěn)定地保持。 我的試驗現(xiàn)象: 最近工作需要,要完成數(shù)百個質(zhì)粒(質(zhì)粒來源相同,插入片段不同,外源片段的引物也不同)的制備,也就是轉化鑒定提取這個步驟。但算下來工作量不小,于是嘗試一次轉化中轉化數(shù)十種質(zhì)粒。問題來了,在隨后的菌落PCR(多重擴增)鑒定過程中發(fā)現(xiàn)我挑取的一個單菌落作為模板擴增,總是能得到不止一種外源片段產(chǎn)物。開始以為可能是存在污染的情況,但陰性對照比較明顯的否定了這個情況。 討論:資料中提到的幾代或幾十代或更長的時間為多久?同源同種不同外源片段的質(zhì)粒在同一宿主中能穩(wěn)定多久?希望有相關經(jīng)驗的大俠來指教一下。TA克隆/建文庫的時候就可以完成質(zhì)粒不相容的過程,那多質(zhì)粒的轉化呢?需要多久可以完成這個過程? |
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| "資料中提到的幾代或幾十代或更長的時間為多久?",我在做發(fā)酵過程中明顯發(fā)現(xiàn)當大腸桿菌傳到100代以后就會出現(xiàn)明顯的質(zhì)粒丟失,在300代時這種現(xiàn)象會變的更加明顯。我前段時間想把一個細胞內(nèi)的質(zhì)粒給丟失掉,只需要在43度條件下培養(yǎng)18個小時后,轉接到0.015%SDS+LB培養(yǎng)基37度培養(yǎng),18個小時后檢測發(fā)現(xiàn)有70%的質(zhì)粒已經(jīng)丟失了。 |
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