 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2275 | 回復(fù): 7 | ||||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||||
[交流]
【求助】分子對(duì)接請(qǐng)教
|
||||
| 我是一個(gè)分子模擬新手，現(xiàn)在主要是藥物分子設(shè)計(jì)方向。在對(duì)接這塊，不是太熟悉，我想了解對(duì)接的整個(gè)步驟和每一個(gè)步驟所需要的各個(gè)文件~請(qǐng)高手指點(diǎn)~~ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 分子對(duì)接問題錦集 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
» 猜你喜歡
323求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿北京化工大學(xué) 070300 學(xué)碩 336分 求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
352求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿東華大學(xué)化學(xué)070300，求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
277材料科學(xué)與工程080500求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
317求調(diào)劑
已經(jīng)有18人回復(fù)
-
293求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
280分求調(diào)劑 一志愿085802
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
0854電子信息求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
263求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 初學(xué)者求助-分子對(duì)接 問題
已經(jīng)有15人回復(fù)
- AutoDock大分子問題
已經(jīng)有11人回復(fù)
- Amber 分子動(dòng)力學(xué) 求助�。。。�
已經(jīng)有10人回復(fù)
- AUTODOCK 分子對(duì)接 gpf對(duì)接參數(shù)問題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 分子對(duì)接時(shí)配體跟受體分開很遠(yuǎn)，配體不在受體活性口袋
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 請(qǐng)教各位有關(guān)分子對(duì)接的問題
已經(jīng)有5人回復(fù)
- sybyl做分子對(duì)接，畫的小分子對(duì)接不成功
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 用Autodock做藥物與BSA的對(duì)接，有點(diǎn)問題請(qǐng)教
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 同源建模需要準(zhǔn)備哪些資料
已經(jīng)有5人回復(fù)
- surflex-dock對(duì)接問題
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 分子對(duì)接及打分函數(shù)
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 分子對(duì)接的免費(fèi)軟件？
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 分子對(duì)接前配體是怎么處理的啊-例如用AD做
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 做分子對(duì)接前選擇配體和受體時(shí)有什么要求嗎？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 用AutoDock作分子對(duì)接前的小分子能量最小化問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】從同源建模開始，一個(gè)完整的分子對(duì)接實(shí)驗(yàn)需要多久？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】分子對(duì)接軟件到底哪個(gè)好？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【討論】分子對(duì)接的基本問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】如何實(shí)現(xiàn)兩個(gè)小分子之間的對(duì)接？！
已經(jīng)有15人回復(fù)
» 搶金幣啦！回帖就可以得到:
-
南京醫(yī)科大學(xué)生殖醫(yī)學(xué)與子代健康國重實(shí)驗(yàn)室-董飛宏課題組-學(xué)術(shù)碩士招生
+1/93
-
招收材料與化學(xué)相關(guān)專業(yè)碩士研究生
+1/81
-
溫州大學(xué)呂晶晶課題組2026年招生
+1/76
-
“雙一流”高�；ゎ惒┦俊吧暾�(qǐng)-考核”招生 江蘇南京
+5/70
-
飄在美國，有點(diǎn)想家
+1/51
-
招收2026年材料與化工專碩調(diào)劑，山東省屬重點(diǎn)大學(xué)，過國家線即可調(diào)劑，名額充足
+2/46
-
招收2026年材料與化工專碩調(diào)劑，山東省屬重點(diǎn)大學(xué)，過國家線即可調(diào)劑，名額充足
+2/38
-
2026 物理方向招收部分調(diào)劑
+1/33
-
1
+1/31
-
中國科學(xué)院杭州醫(yī)學(xué)研究所覃江江課題組招聘博士后
+1/30
-
從�？埔宦返�211碩士，到TOP5博士，也想進(jìn)高校體制
+1/30
-
招聘科研助理——儲(chǔ)能方向（儲(chǔ)能、流體傳熱、CFD模擬）
+1/16
-
西南某211招27屆博士
+1/12
-
shu湘潭大學(xué)化工學(xué)院招收化工、能源動(dòng)力、工程熱物理相關(guān)研究生調(diào)劑
+1/9
-
北京航空航天大學(xué)招生微流控與智能打印技術(shù)方向博士研究生
+2/8
-
[求調(diào)劑]鄭州大學(xué)生物技術(shù)專業(yè) 一志愿浙大生科院340分
+1/7
-
福州大學(xué)國家級(jí)人才湯育欣教授課題組2026年招收”申請(qǐng)考核制“儲(chǔ)能電池方向博士研究生
+1/6
-
天津工業(yè)大學(xué)雙一流高校招博士、碩士、博士后
+1/6
-
寧波東方理工大學(xué)余鵬課題組2026年上海交大聯(lián)培博士生、博士后、科研助理招聘
+1/4
-
MTI 380調(diào)劑
+1/1
5樓2011-09-05 18:58:34
2樓2011-03-24 09:06:50
御劍江湖
榮譽(yù)版主 (著名寫手)
- 模擬EPI: 15
- 應(yīng)助: 7 (幼兒園)
- 貴賓: 6.831
- 金幣: 9082.9
- 帖子: 2917
- 在線: 1251.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 1229656
★ ★ ★ ★ ★ ★
ghcacj(金幣+6): 謝謝 2011-03-27 09:20:43
ghcacj(金幣+6): 謝謝 2011-03-27 09:20:43
|
分子對(duì)接，和構(gòu)效關(guān)系一樣，在每個(gè)實(shí)際案例中，都是能適應(yīng)比較小的范疇，而不應(yīng)推廣到較大的范疇。這有點(diǎn)像分析化學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)曲線，不同的成分，在吸光度方面的變化呈線性（蘭博-比爾定律），只能是在一個(gè)有限的濃度范圍內(nèi)。 對(duì)受體、配體進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化是有必要的，但沒必要過度優(yōu)化。 因?yàn)榉肿訉?duì)接的本意，是： （1）比較一系列結(jié)構(gòu)非常近似的配體，與同一受體的相互作用，或者 （2）同一配體自身，若干“合理”構(gòu)象，與同一受體的相互作用 從中找出比較“好”的對(duì)接姿態(tài)和能量。 就能量計(jì)算的絕對(duì)性來說，分子對(duì)接（軟件）過程本身，就是一個(gè)相當(dāng)粗略的步驟（分子力學(xué)，非量子化學(xué)），因此，它的長處是比較相對(duì)性，而不是絕對(duì)性。 如果哪個(gè)配體有個(gè)另類的取代基（與其它配體相同位置的取代基差別很大），或者弄個(gè)出類拔萃、德藝雙馨的構(gòu)象，分子對(duì)接的結(jié)果只能是個(gè)悲劇。 對(duì)接打分函數(shù)本身，就是一個(gè)統(tǒng)計(jì)性的結(jié)果而已。可以發(fā)明自己的打分函數(shù)，比如特別適合含鹵素的配體，但請(qǐng)你還是把氟給排除在外吧。 |
3樓2011-03-25 17:16:25
7樓2013-03-23 14:32:34
簡單回復(fù)
wwb1684樓
2011-08-07 10:45
回復(fù)
送鮮花一朵
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 352求調(diào)劑 +3 | 大米飯！ 2026-03-22 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑 +11 | 楓橋ZL 2026-03-18 | 13/650 |
|
|
[考研] 一志愿上海交大生物與醫(yī)藥專碩324分，求調(diào)劑 +3 | jiajunX 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿中南化學(xué)（0703）總分337求調(diào)劑 +9 | niko- 2026-03-19 | 10/500 |
|
|
|
[考博] 招收博士1-2人 +3 | QGZDSYS 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 286分人工智能專業(yè)請(qǐng)求調(diào)劑愿意跨考！ +4 | lemonzzn 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 呼呼？~+123456 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +11 | 戲精丹丹丹 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)]
學(xué)校已經(jīng)提交到NSFC，還能修改嗎？
40+4
|
babangida 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿山大07化學(xué) 332分 四六級(jí)已過 本科山東雙非 求調(diào)劑！ +3 | 不想理你 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 機(jī)械專碩299求調(diào)劑至材料 +3 | kkcoco25 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿:南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分 +4 | @taotao 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 材料與化工 322求調(diào)劑
+4
|
然11 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)求調(diào)劑 +4 | Stella_Yao 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工調(diào)劑 324分 +10 | llllkkkhh 2026-03-18 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 材料考研調(diào)劑 +3 | xwt。 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 【同濟(jì)軟件】軟件（085405）考研求調(diào)劑 +3 | 2026eternal 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +3 | 妮妮ninicgb 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|