 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2341 | 回復: 6 | ||||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||||
yylkmb鐵蟲 (正式寫手)
|
[交流]
【交流】基于化學遺傳學的新天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn) 已有6人參與
|
|||
|
前一段發(fā)過一個基于基因資源的新天然產(chǎn)物發(fā)現(xiàn)的帖子，關注的人比較多。所以結(jié)合最近看的文獻再發(fā)一個基于化學遺傳學的策略來研究天然產(chǎn)物（微生物來源）的帖子，希望大家能夠發(fā)表自己的見解積極討論： [img]一.化學遺傳學：[/img] 化學遺傳學的研究歷史雖然只有短短的十多年，但由于其特殊的特點已經(jīng)在很多研究中得到應用。其核心的研究策略包括正向化學遺傳學和反向化學遺傳學。其中正向化學遺傳學是指，以細胞（原核，真核）或者有機體本身為靶標，采用小分子化合物高通量篩選突變體，然后進一步尋找小分子化合物的具體的蛋白，或者基因靶標，進而確定蛋白以及基因的功能；而反向化學遺傳學是指采用已經(jīng)得到的蛋白為靶點，采用高通量篩選的方法找出與之有相互作用的小分子配體，在用這些化合物處理細胞或者有機體觀察其功能，進而確定該蛋白的功能�？梢哉f化學遺傳學跟分子遺傳學一樣是遺傳學的一個分支，由于其可控的和可逆的（可以隨時加入或除去化合物，從而啟動或中斷特定的反應）特性，目前已經(jīng)在信號轉(zhuǎn)導，藥物開發(fā)，功能基因組學等方向的研究中得到了廣泛的應用。 二.天然產(chǎn)物化學背景介紹： 現(xiàn)代天然產(chǎn)物化學研究已經(jīng)有兩百多年歷史，在其發(fā)展過程中不僅對有機化學，及現(xiàn)代分析技術產(chǎn)生了推動作用，更重要的是為現(xiàn)代藥物治療提供了大量的先導化合物。近年來由于現(xiàn)代分離，檢測技術的引用天然產(chǎn)物化學研究在微量，及結(jié)構(gòu)復雜成分的研究方面取得了一定的成就，但是由于大量出現(xiàn)的重復分離化合物的問題以及在分離上的盲目性等使得其進一步發(fā)展遇到了瓶頸。而最近出現(xiàn)的全基因組測序，以及現(xiàn)代分子生物學方法的引入給天然產(chǎn)物研究注入了新的活力�，F(xiàn)在研究的比較火的“基于基因資源的新的天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)”（genome mining find natural products)就是一個很好的例子，但是其主流的研究方法是采用分子生物學的方法如：次生代謝產(chǎn)物基因簇的異源表達，插入強啟動子活化沉默基因簇，以及通過表達特異性的調(diào)控因子等方法（這方面可以參考我之前寫過的一篇博文“基于基因資源的天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)”）。這些方法對于傳統(tǒng)的天然產(chǎn)物化學研究的人來說往往難以開展，因此有必要開發(fā)更多的方法。 三.小分子誘導的天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)： 在長期的微生物天然產(chǎn)物的研究中發(fā)現(xiàn)，培養(yǎng)條件的改變往往能夠改變微生物的生長狀況以及次生代謝情況。早在上世紀90年代就有人就提出了“一個物種多個化合物”的學說，即是指同一個細菌或者是真菌在不同的培養(yǎng)條件下會得到不同的化合物，最近隨著各種微生物的全基因組測序，發(fā)現(xiàn)在這些微生物的基因組中存在著大量的跟次生代謝有關的基因簇，遠遠超過從這些微生物中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的化合物，因此將這些對應基因稱為“cryptic gene cluster”對應的天然產(chǎn)物稱為“隱形天然產(chǎn)物”，這就給“一個物種多個化合物”的學說提供了一個很好的證據(jù)，在一般情況下這些“隱形生物合成基因簇”是沉默的，只有在某些特殊的條件下他才會被活化并表達出相應的天然產(chǎn)物。在長期的研究過程中發(fā)現(xiàn)，培養(yǎng)過程中加入某些特殊的小分子化合物往往能夠激發(fā)這些沉默的天然產(chǎn)物。常見的化合物主要有：1.DNA甲基化酶，組蛋白去乙酰化酶抑制劑。2.多糖類化合物。3.某些合成酶的抑制劑。4.重金屬離子（這方面關于次生代謝產(chǎn)物量的影響的研究，國內(nèi)也有很多文章）等。目前采用這種方法已經(jīng)得到了十多個新的天然產(chǎn)物，由于其操作的簡單方便，易于開展等特點使得該方法得到了廣泛應用。 四.基于化學遺傳學的天然產(chǎn)物的研究： 化學生物學（化學遺傳學）的核心是采用小分子化合物來調(diào)控生物體的生命活動過程，因此采用小分子化合物調(diào)控微生物的次生代謝產(chǎn)物的合成從理論上來說是合理的，基于此采用化學遺傳學的方法研究微生物次生代謝產(chǎn)物是很有意義的。目前雖然基于小分子誘導的天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)的報道已很多，但是主要是通過隨機的實驗研究，有關其機理及化學遺傳學的研究還較少，因此有必要進一步開展化學遺傳學的研究。一方面可以采用反向化學遺傳學的方法，通過現(xiàn)有的關于次生代謝產(chǎn)物合成的調(diào)控的機制的知識，找出調(diào)控相關的蛋白，再通過高通量篩選找出可以與其相互作用的小分子化合物，然后用這些化合物處理微生物檢測其次生代謝產(chǎn)物，進而確定其是否具有活化次生代謝產(chǎn)物合成的作用；另一方面可以采用正向化學遺傳學方法，直接拿微生物篩小分子化合物得到可以活化次生代謝產(chǎn)物的小分子化合物，再找出其對應的蛋白或者基因靶點，確定這些蛋白的功能，在發(fā)現(xiàn)小分子活化次生代謝產(chǎn)物方法的同時可以得到跟次生代謝產(chǎn)物生物合成調(diào)控相關的信息。這樣隨著化學遺傳學研究的進行，可以清楚小分子化合物調(diào)控微生物次生代謝的機制，進而可以合理的設計出采用小分子化合物調(diào)控微生物次生代謝得到新的天然產(chǎn)物的方法。相信化學遺傳學方法的引入一定會給微生物天然產(chǎn)物的研究帶來新的變革。。。 |
回復此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 《讀懂天然產(chǎn)物系列》 |
» 猜你喜歡
一志愿北化求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
085601材料工程找調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復
-
318一志愿吉林大學生物與醫(yī)藥 求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
一志愿雙一流機械285分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
332求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復
-
一志愿鄭州大學，080500學碩，總分317分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
一志愿武漢理工，總分321，英一數(shù)二，求老師收留。
已經(jīng)有8人回復
-
375求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
南京大學化學調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
070300化學354求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
» 本主題相關商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 微生物次生代謝產(chǎn)物的研究
已經(jīng)有17人回復
- 天然產(chǎn)物化學方向 申請美國PH.D ,有哪些學�？梢詤⒖�
已經(jīng)有12人回復
- 正向遺傳學方法
已經(jīng)有3人回復
- 天然產(chǎn)物化學 天然藥物化學 植物化學 藥物化學 英文原版圖書
已經(jīng)有282人回復
- 現(xiàn)代分子生物學實驗技術
已經(jīng)有86人回復
- 曲克蘆丁（Troxerutin）是天然產(chǎn)物嗎？
已經(jīng)有7人回復
- 中科院武漢某研究所天然產(chǎn)物（植物）化學研究崗位招聘啟事
已經(jīng)有9人回復
- 天然產(chǎn)物抗生素綜述 Antibacterial Natural Products
已經(jīng)有102人回復
- 求兩封天然產(chǎn)物化學推薦信
已經(jīng)有7人回復
- 天然產(chǎn)物分離純化問題交流
已經(jīng)有16人回復
- 求天然產(chǎn)物化學方面雜志推薦
已經(jīng)有7人回復
- 現(xiàn)代分子生物學（第三版）
已經(jīng)有118人回復
- 新化合物和新天然產(chǎn)物之區(qū)別
已經(jīng)有5人回復
- 亞洲天然產(chǎn)物，是不是要悲劇了？��！
已經(jīng)有16人回復
- 農(nóng)藥學（天然產(chǎn)物化學方向），碩士找工作好難啊~
已經(jīng)有56人回復
- 【求助】誰考過微生物所的天然產(chǎn)物化學？！
已經(jīng)有3人回復
- 【求助】求推薦幾本經(jīng)典的天然產(chǎn)物化學教材
已經(jīng)有3人回復
- 【求助】天然產(chǎn)物的乙�；磻獑栴}
已經(jīng)有6人回復
墨香若水
木蟲 (著名寫手)
小小囧蟲
- 應助: 15 (小學生)
- 金幣: 3059.1
- 散金: 942
- 紅花: 10
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 1408
- 在線: 255.2小時
- 蟲號: 528502
- 注冊: 2008-03-19
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學
多多交流。 
3樓2011-07-05 12:54:29
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
6樓2013-02-19 14:37:39
遠志小草
木蟲 (正式寫手)
- 應助: 8 (幼兒園)
- 金幣: 4858.3
- 散金: 300
- 紅花: 2
- 帖子: 458
- 在線: 104.8小時
- 蟲號: 2686202
- 注冊: 2013-09-27
- 專業(yè): 有機合成
7樓2015-11-23 11:46:20
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 318一志愿吉林大學生物與醫(yī)藥 求調(diào)劑 +3 | 篤行致遠. 2026-03-28 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +8 | 田洪有 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 327求調(diào)劑 +4 | 汲亦昊 2026-03-29 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 2026年華南師范大學歡迎化學，化工，生物，生醫(yī)工等專業(yè)優(yōu)秀學子加入！ +3 | llss0711 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京理工大學本科211材料工程294求調(diào)劑 +7 | mikasa的圍巾 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +8 | RuiFairyrui 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑310 +8 | 溫柔的晚安 2026-03-25 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑求院校招收 +6 | 鶴鯨鴿 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 315求調(diào)劑 +4 | akie... 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 320分，材料與化工專業(yè)，求調(diào)劑 +9 | 一定上岸aaa 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +6 | HanBeiNingZC 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085404求調(diào)劑，總分309，本科經(jīng)歷較為豐富 +4 | 來財aa 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 086000調(diào)劑 +3 | 7901117076 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿陜師大生物學071000，298分，求調(diào)劑 +5 | SYA！ 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +8 | 匹克i 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 341求調(diào)劑 +7 | 青檸檬1 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 一志愿 本科 北科大 化學 343 +6 | 13831862839 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研]
 085602化學工程求調(diào)劑。
+4
|
平樂樂樂 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料與化工328分調(diào)劑 +6 | 。，。，。，。i 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 347求調(diào)劑 +4 | L when 2026-03-25 | 4/200 |
|