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【求助】安裝siesta2.0.2時如何編譯arch.make？？
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汗，又遇到問題了，特請善良的好心的蟲蟲指點~~~~ 前面編譯MKL 和ifort都成功了 后來又安裝了openmpi，可是，如果我不做并行計算，這個MPI不安裝也行吧，安裝了也沒壞處吧？ 俺是菜鳥啊，大俠們多多體諒啊~~ 安裝SIESTA2.0.2時，我的命令是這樣的; 先 tar -zxvf siesta-2.0.2.tgz 解壓縮 然后cd Src 然后cp Sys/intel-mkl.make arch.make 就是把Sys的intel-mkl.make文件拷貝到Src下，然后改名為arch.make吧 之后，是不是要修改arch.make呢 命令是vi arch.make么？這個命令不太符合XP下的編輯習慣，有沒有適合XP編輯下的命令呢？？ 然后，編譯arch.make文件后，是不是輸入$make就可以了？ 下面是我的原始arch.make文件，沒有做任何修改的 我應該改哪些參數呢？ 我看了別人編譯的一些例子，用紅字標記的應該是要改的吧，怎么改呢？還有，貌似我的arch.make好像不完善��？ 求高人指點，小女子感激不盡！  我的系統(tǒng)是ubantu9.04 MKL是10.3.2.137 ifort是2011.2.137 openmpi是1.4.2 ------------------------------------------ # # This file is part of the SIESTA package. # # Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid: # E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal # and J.M.Soler, 1996-2006. # # Use of this software constitutes agreement with the full conditions # given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users. # SIESTA_ARCH=intel-mkl# # Intel fortran compiler for linux with mkl optimized blas and lapack # # Be sure to experiment with different optimization options. # You have quite a number of combinations to try... # FC=ifc # FFLAGS= -w -mp -tpp5 -O3 FFLAGS_DEBUG= -g LDFLAGS=-Vaxlib COMP_LIBS= RANLIB=echo # NETCDF_LIBS= NETCDF_INTERFACE= DEFS_CDF= # MPI_INTERFACE= MPI_INCLUDE= DEFS_MPI= # GUIDE=/opt/intel/mkl/lib/32/libguide.a LAPACK=/opt/intel/mkl/lib/32/libmkl_lapack.a BLAS=/opt/intel/mkl/lib/32/libmkl_p3.a #G2C=/usr/lib/gcc-lib/i386-redhat-linux/2.96/libg2c.a LIBS=$(LAPACK) $(BLAS) $(G2C) $(GUIDE) -lpthread SYS=bsdDEFS= $(DEFS_CDF) $(DEFS_MPI) # .F.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(DEFS) $< .f.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $< .F90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(DEFS) $< .f90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $< # [ Last edited by mayim2008 on 2011-4-6 at 22:01 ] |
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你好，我今天去測試了 ifort編譯是成功的，出現了Command line error: no files specified; for help type "ifort -help" 然后，我又修改了： BLAS=/home/juan/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blas95.a GUIDE文件名始終找不到，不知道為什么 MAKE之后出現： ifort:command line remark #10010 : option" -Vaxlib" is deprecated and will beremoved in a future release. see "-help deprecated" ifort:error #10236:File not found '/home/juan/intel/mkl/lib/ia32/libguide.a" make: ***[siesta] error 1 怎么回事呢？ GUIDE文件名就是沒看到啊 |
9樓2011-04-13 21:11:12
★ ★ ★
zzy870720z(金幣+3, 1ST強帖+1): 謝謝詳細指點 2011-04-06 23:42:17
mayim2008(金幣+5): 太感謝了~~~ 2011-04-07 18:15:16
zzy870720z(金幣+3, 1ST強帖+1): 謝謝詳細指點 2011-04-06 23:42:17
mayim2008(金幣+5): 太感謝了~~~ 2011-04-07 18:15:16
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我沒有安裝過siesta，不了解有什么特別注意的地方，說下我知道的 首先，用不慣vi 你可以使用 gedit arch.make 來編輯它 至于文件中需要修改的地方 GUIDE=/opt/intel/mkl/lib/32/libguide.a LAPACK=/opt/intel/mkl/lib/32/libmkl_lapack.a BLAS=/opt/intel/mkl/lib/32/libmkl_p3.a 這些是數學庫的路徑，應該設置成你系統(tǒng)的情況，也就是說找到libmkl_p3.a，libmkl_lapack.a，libguide.a 在哪，把正確的路徑添加到這里。 另外FC=ifc 這個是你的fortran編譯器命令，現在intel的命令應該是ifort吧 MPI_... 相關行的是設置并行的，如果你不打算并行計算可以忽略 你可以試著執(zhí)行下編譯，看有什么提示 編譯的命令應該是make，不過也可能需要加入選項，比如make -all之類的。你可以看下程序的主文件夾下有沒有Readme，或者打開Makefile文件看文件最開始有沒有相關的提示 |
2樓2011-04-06 23:15:47
★ ★ ★
zzy870720z(金幣+3): 謝謝分享，呵呵 2011-04-07 16:18:39
mayim2008(金幣+5): 謝謝啊~~ 2011-04-07 18:15:38
zzy870720z(金幣+3): 謝謝分享，呵呵 2011-04-07 16:18:39
mayim2008(金幣+5): 謝謝啊~~ 2011-04-07 18:15:38
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我也是用的mkl編譯的。只不過我用的是64位的，當然也有對應的32位的。可以類比一下。 # # This file is part of the SIESTA package. # # Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid: # E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal # and J.M.Soler, 1996- . # # Use of this software constitutes agreement with the full conditions # given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users. # .SUFFIXES: .SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90 SIESTA_ARCH=x86_64-REHL-5.4 FPP= FPP_OUTPUT= FC=mpif90 RANLIB=ranlib SYS=nag SP_KIND=4 DP_KIND=8 KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND) FFLAGS= -O2 -i-static FFLAGS_DEBUG= -g LDFLAGS=-Vaxlib FPPFLAGS= -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DMPI ARFLAGS_EXTRA= FCFLAGS_fixed_f= FCFLAGS_free_f90= FPPFLAGS_fixed_F= FPPFLAGS_free_F90= BLAS_LIBS=-L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_solver_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lguide LAPACK_LIBS=-L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_core BLACS_LIBS=-L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_blacs_openmpi_lp64 SCALAPACK_LIBS=-L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64 COMP_LIBS= NETCDF_LIBS= NETCDF_INTERFACE= LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS) #SIESTA needs an F90 interface to MPI #This will give you SIESTA's own implementation #If your compiler vendor offers an alternative, you may change #to it here. MPI_INTERFACE= libmpi_f90.a MPI_INCLUDE=/home/zhanggp/software/openmpi-1.2.6/include #Dependency rules are created by autoconf according to whether #discrete preprocessing is necessary or not. .F.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F) $< .F90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $< .f.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f) $< .f90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90) $< |
3樓2011-04-07 15:18:10
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你好，今天去編譯了一下，修改了如下參數， FC=ifort LAPACK=/home/juan/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_lapack.a 另，沒有l(wèi)ibmkl_p3.a這個文件啊，只有l(wèi)ibmkl_p4.so文件 也找不到libguide.a文件 make后 出現了： Compilation architecture to be used: intel-mkl If this is not what you want, create the right arch.make file using the models in Sys Hit ^C to abort... ==> Incorporating information about present compilation (compiler and flags) make[1]: Entering directory `/home/syzx/TEM/siesta-2.0.2/Src' ifort -c -w -mp -tpp5 -O3 compinfo.F90 make[1]: ifort: Command not found make[1]: *** [compinfo.o] Error 127 make[1]: Leaving directory `/home/syzx/TEM/siesta-2.0.2/Src' make: *** [version] Error 2 ---------------------------------------------- |
4樓2011-04-08 22:07:49
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