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怎P不出來呢?求解!
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| 準(zhǔn)備克隆表達(dá)一蛋白,從煙曲霉中提RNA反轉(zhuǎn)錄后先做梯度PCR(10ul-10管)得出最佳退火溫度為60度,接下來想做膠回收卻怎么也P不出來目的基因了(1.3kbp),用的是相同的試劑、條件,50ul,100ul體系,50ul分成5管,100ul分成10管最后混合跑電泳都失敗,糾結(jié)啊盼請(qǐng)高手分析原因,謝謝!附梯度條件:94° 1min,94° 5s,60-70°90s,72° 90s,35cycles,72° 10min.用的是Taq酶PCR Green Mix。 |
木蟲 (著名寫手)

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木蟲 (正式寫手)
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1.請(qǐng)驗(yàn)證模板是否OK 2.能否重復(fù)梯度PCR結(jié)果,包括PCR孔也要驗(yàn)證哦 3.是否是一管酶快用完了,剩下的活性不好了,或者不是同一批次的,可以做陽性對(duì)照 4.60-70度的梯度,確定是60度最佳,不科學(xué)啊,怎知降五度就不好呢? 5.應(yīng)該保留梯度PCR產(chǎn)物,可以作為模板二次PCR;或者做陽性對(duì)照 重點(diǎn)檢查模板,以及降低退火溫度,不建議tag,保真性不好 說不定你梯度的那個(gè)孔在最邊緣,設(shè)的六十度,實(shí)際只有58度…… |
木蟲 (正式寫手)
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O(∩_∩)O哈! 不知道大家的實(shí)驗(yàn)材料保存多久? 我記得我一次從基因組里面釣基因出來,PCR出來了,送產(chǎn)物直接去測(cè)序了。 結(jié)果后面再做好幾次,都沒有出來 一怒讓測(cè)序公司把那管子送回來,加了點(diǎn)水涮涮,取出來當(dāng)模板,哈哈,OK 所以以后每次PCR產(chǎn)物,都盡量保存的。 當(dāng)然酶最好用保真性好的,不然二次PCR就增加了突變的可能 |
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